25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_47120 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_47120  hypothetical protein  100 
 
 		 198 aa  406  1.0000000000000001e-112  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.244366  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0601  hypothetical protein  37.5 
 
 		 168 aa  90.1  2e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5108  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  40.43 
 
 		 179 aa  85.9  4e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0207  hypothetical protein  36.73 
 
 		 177 aa  83.6  0.000000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0235844  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0114  hypothetical protein  37.16 
 
 		 191 aa  82.8  0.000000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4469  hypothetical protein  38.46 
 
 		 179 aa  81.3  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0399  hypothetical protein  35.92 
 
 		 174 aa  80.1  0.00000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0962  hypothetical protein  39.01 
 
 		 179 aa  79  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1066  hypothetical protein  39.01 
 
 		 179 aa  79  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3643  tetratricopeptide TPR_2  38.36 
 
 		 180 aa  78.2  0.00000000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.143089 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5901  hypothetical protein  36.55 
 
 		 177 aa  76.6  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.106245  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1533  hypothetical protein  33.58 
 
 		 169 aa  70.9  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0993854  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1249  hypothetical protein  33.58 
 
 		 169 aa  70.9  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.417761  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01660  hypothetical protein  35.33 
 
 		 179 aa  64.3  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1396  hypothetical protein  31.08 
 
 		 179 aa  63.2  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.120988  normal  0.165423 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0257  hypothetical protein  27.03 
 
 		 162 aa  62.4  0.000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3662  hypothetical protein  24.67 
 
 		 161 aa  59.7  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.726286  normal  0.280923 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1192  hypothetical protein  29.84 
 
 		 164 aa  55.8  0.0000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.179925 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1476  hypothetical protein  29.84 
 
 		 164 aa  55.8  0.0000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2103  hypothetical protein  27.91 
 
 		 163 aa  54.3  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000113026 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2634  hypothetical protein  21.54 
 
 		 161 aa  53.9  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0449  hypothetical protein  22.31 
 
 		 161 aa  48.5  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0561788 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5886  hypothetical protein  28.48 
 
 		 161 aa  47.8  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.171898  normal  0.580302 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1407  hypothetical protein  33.03 
 
 		 216 aa  46.6  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7735  tetratricopeptide TPR_2  29.67 
 
 		 161 aa  42.7  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>