29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_0601 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_0601  hypothetical protein  100 
 
 		 168 aa  333  5.999999999999999e-91  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0114  hypothetical protein  40.12 
 
 		 191 aa  124  7e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1533  hypothetical protein  37.2 
 
 		 169 aa  115  1.9999999999999998e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0993854  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1249  hypothetical protein  37.2 
 
 		 169 aa  115  1.9999999999999998e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.417761  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0207  hypothetical protein  40.38 
 
 		 177 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0235844  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5901  hypothetical protein  39.02 
 
 		 177 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.106245  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5108  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  41.84 
 
 		 179 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4469  hypothetical protein  39.35 
 
 		 179 aa  104  7e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0962  hypothetical protein  42.22 
 
 		 179 aa  103  1e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0399  hypothetical protein  34.42 
 
 		 174 aa  102  3e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1066  hypothetical protein  40 
 
 		 179 aa  100  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3643  tetratricopeptide TPR_2  40.65 
 
 		 180 aa  93.6  1e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.143089 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47120  hypothetical protein  37.5 
 
 		 198 aa  90.1  1e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.244366  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1396  hypothetical protein  33.96 
 
 		 179 aa  81.6  0.000000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.120988  normal  0.165423 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0257  hypothetical protein  36.84 
 
 		 162 aa  81.3  0.000000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3662  hypothetical protein  26.97 
 
 		 161 aa  72  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.726286  normal  0.280923 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01660  hypothetical protein  35.82 
 
 		 179 aa  67.8  0.00000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0449  hypothetical protein  28.48 
 
 		 161 aa  67  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0561788 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2103  hypothetical protein  31.62 
 
 		 163 aa  64.7  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000113026 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2634  hypothetical protein  29.71 
 
 		 161 aa  64.7  0.0000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1192  hypothetical protein  30.77 
 
 		 164 aa  60.5  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.179925 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1476  hypothetical protein  30.77 
 
 		 164 aa  60.5  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1407  hypothetical protein  32.89 
 
 		 216 aa  57.4  0.00000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01530  hypothetical protein  31.87 
 
 		 166 aa  57  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5886  hypothetical protein  30.25 
 
 		 161 aa  51.2  0.000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.171898  normal  0.580302 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1577  hypothetical protein  27.81 
 
 		 189 aa  47.4  0.00009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.488602  normal  0.478863 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2402  hypothetical protein  26.71 
 
 		 167 aa  47  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0582691  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7735  tetratricopeptide TPR_2  27.63 
 
 		 161 aa  46.2  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1448  hypothetical protein  29.66 
 
 		 191 aa  46.6  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0056877 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>