32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_5108 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_5108  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  100 
 
 		 179 aa  357  7e-98  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1066  hypothetical protein  80.45 
 
 		 179 aa  278  3e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0962  hypothetical protein  81.56 
 
 		 179 aa  278  4e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4469  hypothetical protein  72.25 
 
 		 179 aa  239  2e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0114  hypothetical protein  65.85 
 
 		 191 aa  216  1e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0399  hypothetical protein  66.46 
 
 		 174 aa  207  5e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0207  hypothetical protein  65.38 
 
 		 177 aa  201  5e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0235844  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5901  hypothetical protein  59.17 
 
 		 177 aa  197  6e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.106245  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3643  tetratricopeptide TPR_2  58.18 
 
 		 180 aa  174  6e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.143089 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1533  hypothetical protein  52.32 
 
 		 169 aa  156  1e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0993854  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1249  hypothetical protein  52.32 
 
 		 169 aa  156  1e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.417761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0601  hypothetical protein  42.07 
 
 		 168 aa  112  2.0000000000000002e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1396  hypothetical protein  43.84 
 
 		 179 aa  100  9e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.120988  normal  0.165423 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01660  hypothetical protein  46.03 
 
 		 179 aa  99.4  2e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0257  hypothetical protein  38.96 
 
 		 162 aa  90.1  2e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1407  hypothetical protein  45.1 
 
 		 216 aa  87.4  9e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47120  hypothetical protein  40.56 
 
 		 198 aa  87.4  9e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.244366  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1192  hypothetical protein  34.55 
 
 		 164 aa  81.3  0.000000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.179925 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1476  hypothetical protein  34.55 
 
 		 164 aa  81.3  0.000000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2103  hypothetical protein  33.57 
 
 		 163 aa  75.5  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000113026 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1448  hypothetical protein  38.18 
 
 		 191 aa  75.1  0.0000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0056877 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7735  tetratricopeptide TPR_2  37.93 
 
 		 161 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1577  hypothetical protein  40.83 
 
 		 189 aa  71.6  0.000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.488602  normal  0.478863 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2402  hypothetical protein  37.29 
 
 		 167 aa  67.8  0.00000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0582691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0449  hypothetical protein  25.17 
 
 		 161 aa  65.5  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0561788 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3525  hypothetical protein  34.26 
 
 		 165 aa  64.7  0.0000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00689073 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01530  hypothetical protein  37.01 
 
 		 166 aa  64.3  0.0000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0126  hypothetical protein  33.53 
 
 		 159 aa  62  0.000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3662  hypothetical protein  23.03 
 
 		 161 aa  61.2  0.000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.726286  normal  0.280923 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2318  tetratricopeptide TPR_2  35.9 
 
 		 159 aa  58.5  0.00000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00165339  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2634  hypothetical protein  22.64 
 
 		 161 aa  58.2  0.00000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5886  hypothetical protein  32.5 
 
 		 161 aa  57  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.171898  normal  0.580302 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>