23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_3525 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_3525  hypothetical protein  100 
 
 		 165 aa  333  7.999999999999999e-91  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00689073 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2402  hypothetical protein  72.39 
 
 		 167 aa  234  5.0000000000000005e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0582691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0126  hypothetical protein  55.35 
 
 		 159 aa  162  2.0000000000000002e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5886  hypothetical protein  54.43 
 
 		 161 aa  155  2e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.171898  normal  0.580302 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7735  tetratricopeptide TPR_2  43.1 
 
 		 161 aa  90.5  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0257  hypothetical protein  37.25 
 
 		 162 aa  86.7  1e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1476  hypothetical protein  42.86 
 
 		 164 aa  85.9  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1192  hypothetical protein  42.86 
 
 		 164 aa  85.9  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.179925 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1533  hypothetical protein  35.14 
 
 		 169 aa  73.9  0.0000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0993854  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1249  hypothetical protein  35.14 
 
 		 169 aa  73.9  0.0000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.417761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2318  tetratricopeptide TPR_2  42.99 
 
 		 159 aa  68.2  0.00000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00165339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0962  hypothetical protein  34.33 
 
 		 179 aa  67  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5108  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.33 
 
 		 179 aa  66.2  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1066  hypothetical protein  32.84 
 
 		 179 aa  63.5  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0207  hypothetical protein  31.25 
 
 		 177 aa  58.9  0.00000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0235844  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0399  hypothetical protein  27.97 
 
 		 174 aa  54.3  0.0000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4469  hypothetical protein  28.03 
 
 		 179 aa  53.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0114  hypothetical protein  28 
 
 		 191 aa  50.1  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1396  hypothetical protein  28.57 
 
 		 179 aa  48.5  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.120988  normal  0.165423 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5901  hypothetical protein  25.42 
 
 		 177 aa  45.8  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.106245  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3643  tetratricopeptide TPR_2  26.21 
 
 		 180 aa  45.8  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.143089 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1577  hypothetical protein  29.63 
 
 		 189 aa  45.4  0.0004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.488602  normal  0.478863 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0601  hypothetical protein  24.66 
 
 		 168 aa  42.7  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>