27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_7735 on replicon NC_010627
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010627  Bphy_7735  tetratricopeptide TPR_2  100 
 
 
161 aa  328  2e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2318  tetratricopeptide TPR_2  58.86 
 
 
159 aa  152  2e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00165339  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0257  hypothetical protein  39.04 
 
 
162 aa  92  3e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3525  hypothetical protein  44.86 
 
 
165 aa  90.5  9e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00689073 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5886  hypothetical protein  38.18 
 
 
161 aa  89.4  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.171898  normal  0.580302 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0126  hypothetical protein  45.13 
 
 
159 aa  84  7e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1476  hypothetical protein  39.17 
 
 
164 aa  83.2  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1192  hypothetical protein  39.17 
 
 
164 aa  83.2  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.179925 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2402  hypothetical protein  36.55 
 
 
167 aa  83.6  0.000000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0582691  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4469  hypothetical protein  37.32 
 
 
179 aa  75.5  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5108  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  43.3 
 
 
179 aa  72.8  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0114  hypothetical protein  32.63 
 
 
191 aa  72  0.000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1533  hypothetical protein  32.67 
 
 
169 aa  70.1  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0993854  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1249  hypothetical protein  32.67 
 
 
169 aa  70.1  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.417761  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0399  hypothetical protein  40 
 
 
174 aa  69.3  0.00000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1066  hypothetical protein  37.61 
 
 
179 aa  65.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0207  hypothetical protein  35.19 
 
 
177 aa  64.7  0.0000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0235844  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0962  hypothetical protein  37.61 
 
 
179 aa  64.7  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01530  hypothetical protein  36.96 
 
 
166 aa  60.8  0.000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5901  hypothetical protein  34.29 
 
 
177 aa  57.8  0.00000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.106245  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3643  tetratricopeptide TPR_2  36.84 
 
 
180 aa  57  0.0000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.143089 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1407  hypothetical protein  34.11 
 
 
216 aa  52.8  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1577  hypothetical protein  33.33 
 
 
189 aa  52.8  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.488602  normal  0.478863 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1448  hypothetical protein  32.89 
 
 
191 aa  49.7  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0056877 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1396  hypothetical protein  29.59 
 
 
179 aa  48.5  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.120988  normal  0.165423 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0601  hypothetical protein  27.63 
 
 
168 aa  46.2  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47120  hypothetical protein  29.67 
 
 
198 aa  42.7  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.244366  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>