24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0126 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_0126  hypothetical protein  100 
 
 		 159 aa  323  7e-88  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5886  hypothetical protein  68.35 
 
 		 161 aa  218  1.9999999999999999e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.171898  normal  0.580302 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2402  hypothetical protein  55.21 
 
 		 167 aa  154  6e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0582691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3525  hypothetical protein  55.35 
 
 		 165 aa  147  5e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00689073 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0257  hypothetical protein  39.46 
 
 		 162 aa  89.4  2e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7735  tetratricopeptide TPR_2  45.13 
 
 		 161 aa  84  7e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1476  hypothetical protein  34.87 
 
 		 164 aa  78.6  0.00000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1192  hypothetical protein  34.87 
 
 		 164 aa  78.6  0.00000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.179925 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0962  hypothetical protein  38.52 
 
 		 179 aa  68.6  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1533  hypothetical protein  35.04 
 
 		 169 aa  67.4  0.00000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0993854  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1249  hypothetical protein  35.04 
 
 		 169 aa  67.4  0.00000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.417761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2318  tetratricopeptide TPR_2  41.67 
 
 		 159 aa  67  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00165339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1066  hypothetical protein  36.07 
 
 		 179 aa  63.9  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5108  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.25 
 
 		 179 aa  60.8  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4469  hypothetical protein  34.35 
 
 		 179 aa  58.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0207  hypothetical protein  32.84 
 
 		 177 aa  57.4  0.00000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0235844  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3643  tetratricopeptide TPR_2  30.43 
 
 		 180 aa  55.5  0.0000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.143089 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0399  hypothetical protein  32.26 
 
 		 174 aa  55.1  0.0000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1577  hypothetical protein  33.81 
 
 		 189 aa  55.1  0.0000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.488602  normal  0.478863 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0114  hypothetical protein  30.14 
 
 		 191 aa  53.9  0.0000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1448  hypothetical protein  31.25 
 
 		 191 aa  49.3  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0056877 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1396  hypothetical protein  29.81 
 
 		 179 aa  45.1  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.120988  normal  0.165423 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5901  hypothetical protein  27.87 
 
 		 177 aa  42.4  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.106245  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1407  hypothetical protein  29.33 
 
 		 216 aa  42  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>