32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_5901 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_5901  hypothetical protein  100 
 
 		 177 aa  359  1e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.106245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0114  hypothetical protein  67.48 
 
 		 191 aa  231  5e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0207  hypothetical protein  65.38 
 
 		 177 aa  201  4e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0235844  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0399  hypothetical protein  59.41 
 
 		 174 aa  190  9e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4469  hypothetical protein  59.15 
 
 		 179 aa  185  3e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0962  hypothetical protein  61.33 
 
 		 179 aa  182  3e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5108  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  60 
 
 		 179 aa  181  7e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1066  hypothetical protein  58.28 
 
 		 179 aa  176  1e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3643  tetratricopeptide TPR_2  58.43 
 
 		 180 aa  170  7.999999999999999e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.143089 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1533  hypothetical protein  52.94 
 
 		 169 aa  156  1e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0993854  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1249  hypothetical protein  52.94 
 
 		 169 aa  156  1e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.417761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0601  hypothetical protein  39.02 
 
 		 168 aa  112  2.0000000000000002e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1407  hypothetical protein  45.45 
 
 		 216 aa  99.8  2e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01660  hypothetical protein  42.19 
 
 		 179 aa  98.6  4e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1577  hypothetical protein  40.51 
 
 		 189 aa  92  4e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.488602  normal  0.478863 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1396  hypothetical protein  38.41 
 
 		 179 aa  88.2  5e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.120988  normal  0.165423 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0257  hypothetical protein  33.11 
 
 		 162 aa  82.4  0.000000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1448  hypothetical protein  36.9 
 
 		 191 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0056877 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2103  hypothetical protein  30.46 
 
 		 163 aa  78.6  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000113026 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47120  hypothetical protein  36.55 
 
 		 198 aa  76.6  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.244366  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3662  hypothetical protein  25.17 
 
 		 161 aa  72.8  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.726286  normal  0.280923 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0449  hypothetical protein  25.52 
 
 		 161 aa  68.9  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0561788 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2634  hypothetical protein  25.85 
 
 		 161 aa  68.2  0.00000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1192  hypothetical protein  30.07 
 
 		 164 aa  60.5  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.179925 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1476  hypothetical protein  30.07 
 
 		 164 aa  60.5  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7735  tetratricopeptide TPR_2  34.29 
 
 		 161 aa  57.8  0.00000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5886  hypothetical protein  29.93 
 
 		 161 aa  57.4  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.171898  normal  0.580302 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2402  hypothetical protein  27.46 
 
 		 167 aa  50.8  0.000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0582691  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01530  hypothetical protein  29.23 
 
 		 166 aa  48.1  0.00006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3525  hypothetical protein  25.93 
 
 		 165 aa  45.1  0.0005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00689073 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0126  hypothetical protein  27.87 
 
 		 159 aa  42.4  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0674  hypothetical protein  26.92 
 
 		 294 aa  42  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000249433 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>