20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_3662 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_3662  hypothetical protein  100 
 
 
161 aa  327  4e-89  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.726286  normal  0.280923 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2634  hypothetical protein  51.55 
 
 
161 aa  182  2.0000000000000003e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0449  hypothetical protein  49.07 
 
 
161 aa  177  7e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0561788 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2103  hypothetical protein  47.77 
 
 
163 aa  162  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000113026 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0114  hypothetical protein  29.61 
 
 
191 aa  87  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5901  hypothetical protein  25.17 
 
 
177 aa  72.8  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.106245  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0601  hypothetical protein  26.97 
 
 
168 aa  72  0.000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01660  hypothetical protein  28 
 
 
179 aa  67  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0962  hypothetical protein  25.17 
 
 
179 aa  62.8  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5108  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.18 
 
 
179 aa  61.2  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0207  hypothetical protein  21.71 
 
 
177 aa  60.1  0.00000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0235844  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47120  hypothetical protein  24.67 
 
 
198 aa  59.7  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.244366  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1249  hypothetical protein  21.19 
 
 
169 aa  57.4  0.00000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.417761  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1533  hypothetical protein  21.19 
 
 
169 aa  57.4  0.00000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0993854  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1066  hypothetical protein  23.18 
 
 
179 aa  55.5  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0399  hypothetical protein  22.52 
 
 
174 aa  54.3  0.0000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4469  hypothetical protein  22.37 
 
 
179 aa  52.4  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3955  hypothetical protein  42 
 
 
55 aa  50.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.752503  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1396  hypothetical protein  20.57 
 
 
179 aa  47  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.120988  normal  0.165423 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0257  hypothetical protein  20 
 
 
162 aa  45.8  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>