22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_2103 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_2103  hypothetical protein  100 
 
 
163 aa  329  9e-90  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000113026 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3662  hypothetical protein  47.77 
 
 
161 aa  162  2.0000000000000002e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.726286  normal  0.280923 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2634  hypothetical protein  46.45 
 
 
161 aa  157  5e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0449  hypothetical protein  46.45 
 
 
161 aa  154  4e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0561788 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5901  hypothetical protein  30.46 
 
 
177 aa  78.6  0.00000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.106245  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01660  hypothetical protein  36.29 
 
 
179 aa  76.3  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5108  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.43 
 
 
179 aa  75.5  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1066  hypothetical protein  33.1 
 
 
179 aa  72  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0114  hypothetical protein  30.46 
 
 
191 aa  71.6  0.000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0962  hypothetical protein  30.41 
 
 
179 aa  68.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0399  hypothetical protein  28.83 
 
 
174 aa  65.9  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0601  hypothetical protein  31.62 
 
 
168 aa  64.7  0.0000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1249  hypothetical protein  27.27 
 
 
169 aa  61.2  0.000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.417761  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1533  hypothetical protein  27.27 
 
 
169 aa  61.2  0.000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0993854  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4469  hypothetical protein  30.07 
 
 
179 aa  60.5  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1396  hypothetical protein  27.21 
 
 
179 aa  54.3  0.0000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.120988  normal  0.165423 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47120  hypothetical protein  27.91 
 
 
198 aa  54.3  0.0000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.244366  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0207  hypothetical protein  26.21 
 
 
177 aa  52.4  0.000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0235844  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3955  hypothetical protein  40 
 
 
55 aa  46.6  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.752503  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3643  tetratricopeptide TPR_2  27.73 
 
 
180 aa  45.4  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.143089 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1577  hypothetical protein  28.45 
 
 
189 aa  45.1  0.0004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.488602  normal  0.478863 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0257  hypothetical protein  29.37 
 
 
162 aa  42.7  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>