21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_0449 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_0449  hypothetical protein  100 
 
 
161 aa  331  2e-90  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0561788 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2634  hypothetical protein  65.84 
 
 
161 aa  224  5.0000000000000005e-58  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3662  hypothetical protein  49.07 
 
 
161 aa  177  7e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.726286  normal  0.280923 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2103  hypothetical protein  46.45 
 
 
163 aa  154  4e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000113026 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0114  hypothetical protein  27.81 
 
 
191 aa  77  0.00000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01660  hypothetical protein  30.95 
 
 
179 aa  69.3  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5901  hypothetical protein  25.52 
 
 
177 aa  68.9  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.106245  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0601  hypothetical protein  28.48 
 
 
168 aa  67  0.00000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5108  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.33 
 
 
179 aa  65.5  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0962  hypothetical protein  25.33 
 
 
179 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0207  hypothetical protein  24.5 
 
 
177 aa  58.5  0.00000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0235844  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4469  hypothetical protein  25 
 
 
179 aa  57.8  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0399  hypothetical protein  23.23 
 
 
174 aa  55.8  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3955  hypothetical protein  52 
 
 
55 aa  54.7  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.752503  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1066  hypothetical protein  24 
 
 
179 aa  54.3  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0257  hypothetical protein  23.45 
 
 
162 aa  53.9  0.0000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1249  hypothetical protein  23.84 
 
 
169 aa  52.8  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.417761  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1533  hypothetical protein  23.84 
 
 
169 aa  52.8  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0993854  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47120  hypothetical protein  22.31 
 
 
198 aa  48.5  0.00004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.244366  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3643  tetratricopeptide TPR_2  23.89 
 
 
180 aa  45.1  0.0004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.143089 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1396  hypothetical protein  20.83 
 
 
179 aa  45.1  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.120988  normal  0.165423 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>