26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_01660 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_01660  hypothetical protein  100 
 
 
179 aa  349  8.999999999999999e-96  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1396  hypothetical protein  46.67 
 
 
179 aa  138  4.999999999999999e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.120988  normal  0.165423 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0114  hypothetical protein  46.77 
 
 
191 aa  101  6e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5108  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  46.03 
 
 
179 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5901  hypothetical protein  41.35 
 
 
177 aa  98.6  4e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.106245  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4469  hypothetical protein  45.9 
 
 
179 aa  96.3  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0962  hypothetical protein  43.41 
 
 
179 aa  92.8  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1066  hypothetical protein  44 
 
 
179 aa  91.3  6e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1533  hypothetical protein  39.61 
 
 
169 aa  91.3  7e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0993854  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1249  hypothetical protein  39.61 
 
 
169 aa  91.3  7e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.417761  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0399  hypothetical protein  38.46 
 
 
174 aa  87.4  1e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2103  hypothetical protein  34.67 
 
 
163 aa  80.1  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000113026 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3643  tetratricopeptide TPR_2  37.61 
 
 
180 aa  78.6  0.00000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.143089 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0207  hypothetical protein  36.31 
 
 
177 aa  77.8  0.00000000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0235844  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1577  hypothetical protein  42.96 
 
 
189 aa  75.9  0.0000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.488602  normal  0.478863 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1407  hypothetical protein  41.38 
 
 
216 aa  71.6  0.000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3662  hypothetical protein  28 
 
 
161 aa  71.2  0.000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.726286  normal  0.280923 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0449  hypothetical protein  31.25 
 
 
161 aa  70.5  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0561788 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47120  hypothetical protein  34.64 
 
 
198 aa  68.6  0.00000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.244366  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0601  hypothetical protein  35.82 
 
 
168 aa  67.8  0.00000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1448  hypothetical protein  38.71 
 
 
191 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0056877 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2634  hypothetical protein  33.05 
 
 
161 aa  62.8  0.000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0257  hypothetical protein  32.41 
 
 
162 aa  62  0.000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1476  hypothetical protein  29.05 
 
 
164 aa  45.4  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1192  hypothetical protein  29.05 
 
 
164 aa  45.4  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.179925 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01530  hypothetical protein  29.66 
 
 
166 aa  44.7  0.0007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>