31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_1396 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_1396  hypothetical protein  100 
 
 
179 aa  352  1e-96  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.120988  normal  0.165423 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01660  hypothetical protein  46.67 
 
 
179 aa  133  1.9999999999999998e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5108  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  43.75 
 
 
179 aa  99.8  2e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0962  hypothetical protein  42.36 
 
 
179 aa  92.8  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1533  hypothetical protein  40.52 
 
 
169 aa  92.4  3e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0993854  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1249  hypothetical protein  40.52 
 
 
169 aa  92.4  3e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.417761  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3643  tetratricopeptide TPR_2  40.91 
 
 
180 aa  90.9  8e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.143089 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1066  hypothetical protein  40.97 
 
 
179 aa  89.7  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5901  hypothetical protein  38.41 
 
 
177 aa  88.2  5e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.106245  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0399  hypothetical protein  40 
 
 
174 aa  88.2  5e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0114  hypothetical protein  36.99 
 
 
191 aa  84.3  9e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4469  hypothetical protein  39.73 
 
 
179 aa  84  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0601  hypothetical protein  33.96 
 
 
168 aa  81.6  0.000000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1407  hypothetical protein  40.91 
 
 
216 aa  81.3  0.000000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0207  hypothetical protein  36.91 
 
 
177 aa  78.6  0.00000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0235844  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0257  hypothetical protein  31.48 
 
 
162 aa  69.7  0.00000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1577  hypothetical protein  34.66 
 
 
189 aa  64.7  0.0000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.488602  normal  0.478863 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47120  hypothetical protein  31.08 
 
 
198 aa  63.2  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.244366  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01530  hypothetical protein  32.14 
 
 
166 aa  62  0.000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1192  hypothetical protein  33.33 
 
 
164 aa  59.3  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.179925 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1476  hypothetical protein  33.33 
 
 
164 aa  59.3  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1448  hypothetical protein  34.06 
 
 
191 aa  57  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0056877 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2402  hypothetical protein  29.22 
 
 
167 aa  55.5  0.0000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0582691  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2103  hypothetical protein  27.21 
 
 
163 aa  54.3  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000113026 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2634  hypothetical protein  24.58 
 
 
161 aa  52  0.000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5886  hypothetical protein  30.52 
 
 
161 aa  49.7  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.171898  normal  0.580302 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7735  tetratricopeptide TPR_2  29.59 
 
 
161 aa  48.5  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3662  hypothetical protein  20.57 
 
 
161 aa  47  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.726286  normal  0.280923 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3525  hypothetical protein  30.84 
 
 
165 aa  46.6  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00689073 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0126  hypothetical protein  29.81 
 
 
159 aa  45.1  0.0005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0449  hypothetical protein  20.83 
 
 
161 aa  45.1  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0561788 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>