26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B1448 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007952  Bxe_B1448  hypothetical protein  100 
 
 
191 aa  369  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0056877 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1577  hypothetical protein  69.11 
 
 
189 aa  252  2.0000000000000002e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.488602  normal  0.478863 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1407  hypothetical protein  46.43 
 
 
216 aa  108  4.0000000000000004e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0114  hypothetical protein  42.33 
 
 
191 aa  99.8  2e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0207  hypothetical protein  37.42 
 
 
177 aa  91.3  7e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0235844  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0399  hypothetical protein  38.51 
 
 
174 aa  90.9  1e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5901  hypothetical protein  36.9 
 
 
177 aa  89.7  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.106245  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4469  hypothetical protein  38.79 
 
 
179 aa  87.8  9e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3643  tetratricopeptide TPR_2  40.12 
 
 
180 aa  80.1  0.00000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.143089 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0962  hypothetical protein  40.31 
 
 
179 aa  78.6  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0257  hypothetical protein  37.91 
 
 
162 aa  78.2  0.00000000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5108  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  41.13 
 
 
179 aa  76.6  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1066  hypothetical protein  39.17 
 
 
179 aa  75.1  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01660  hypothetical protein  38.71 
 
 
179 aa  70.9  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1249  hypothetical protein  36.59 
 
 
169 aa  67  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.417761  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1533  hypothetical protein  36.59 
 
 
169 aa  67  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0993854  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5886  hypothetical protein  35.92 
 
 
161 aa  66.2  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.171898  normal  0.580302 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1396  hypothetical protein  33.94 
 
 
179 aa  62.4  0.000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.120988  normal  0.165423 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7735  tetratricopeptide TPR_2  32.89 
 
 
161 aa  61.2  0.000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0126  hypothetical protein  31.25 
 
 
159 aa  55.1  0.0000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01530  hypothetical protein  32.26 
 
 
166 aa  54.7  0.0000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0601  hypothetical protein  29.66 
 
 
168 aa  52  0.000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1192  hypothetical protein  30.28 
 
 
164 aa  51.6  0.000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.179925 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1476  hypothetical protein  30.28 
 
 
164 aa  51.6  0.000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2318  tetratricopeptide TPR_2  46.94 
 
 
159 aa  49.7  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00165339  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2103  hypothetical protein  28.45 
 
 
163 aa  45.4  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000113026 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>