28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_1192 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_1192  hypothetical protein  100 
 
 		 164 aa  333  7.999999999999999e-91  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.179925 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1476  hypothetical protein  100 
 
 		 164 aa  333  7.999999999999999e-91  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0257  hypothetical protein  45.64 
 
 		 162 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2402  hypothetical protein  37.09 
 
 		 167 aa  85.9  2e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0582691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3525  hypothetical protein  42.86 
 
 		 165 aa  85.9  2e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00689073 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5886  hypothetical protein  36.6 
 
 		 161 aa  84  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.171898  normal  0.580302 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7735  tetratricopeptide TPR_2  39.17 
 
 		 161 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5108  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  38.98 
 
 		 179 aa  80.1  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0126  hypothetical protein  34.87 
 
 		 159 aa  78.6  0.00000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01530  hypothetical protein  41.26 
 
 		 166 aa  72.8  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2318  tetratricopeptide TPR_2  38.1 
 
 		 159 aa  72.4  0.000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00165339  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1533  hypothetical protein  37.74 
 
 		 169 aa  71.6  0.000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0993854  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1249  hypothetical protein  37.74 
 
 		 169 aa  71.6  0.000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.417761  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0207  hypothetical protein  35.85 
 
 		 177 aa  72  0.000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0235844  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4469  hypothetical protein  33.82 
 
 		 179 aa  70.9  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0114  hypothetical protein  29.68 
 
 		 191 aa  64.3  0.0000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1066  hypothetical protein  31.39 
 
 		 179 aa  63.2  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0962  hypothetical protein  33.96 
 
 		 179 aa  63.5  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0399  hypothetical protein  31.63 
 
 		 174 aa  62.8  0.000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5901  hypothetical protein  30.07 
 
 		 177 aa  60.5  0.000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.106245  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0601  hypothetical protein  30.77 
 
 		 168 aa  60.5  0.00000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3643  tetratricopeptide TPR_2  29.57 
 
 		 180 aa  59.3  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.143089 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1396  hypothetical protein  33.33 
 
 		 179 aa  59.3  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.120988  normal  0.165423 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47120  hypothetical protein  29.84 
 
 		 198 aa  55.8  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.244366  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1407  hypothetical protein  29.94 
 
 		 216 aa  52.8  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1577  hypothetical protein  30.88 
 
 		 189 aa  48.1  0.00005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.488602  normal  0.478863 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01660  hypothetical protein  30.56 
 
 		 179 aa  44.3  0.0007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1448  hypothetical protein  31.69 
 
 		 191 aa  42.7  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0056877 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>