31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1237 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_1237  hypothetical protein  100 
 
 
121 aa  236  9e-62  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.106406  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2486  hypothetical protein  44.44 
 
 
121 aa  105  3e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0794808  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2494  hypothetical protein  44.17 
 
 
122 aa  104  4e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.255706 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4898  hypothetical protein  44.95 
 
 
124 aa  99  2e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.135304  normal  0.116752 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1772  hypothetical protein  40 
 
 
122 aa  89.7  1e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.46345  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2504  hypothetical protein  40 
 
 
124 aa  84  7e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0428  hypothetical protein  37.19 
 
 
125 aa  81.3  0.000000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4280  hypothetical protein  41.07 
 
 
115 aa  80.9  0.000000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2206  hypothetical protein  40.83 
 
 
120 aa  79  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000336434 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0440  hypothetical protein  40.5 
 
 
122 aa  72.4  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.728055  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3291  hypothetical protein  35 
 
 
122 aa  68.9  0.00000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4084  hypothetical protein  38.84 
 
 
122 aa  68.9  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1815  hypothetical protein  31.09 
 
 
125 aa  63.2  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.245824  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1637  hypothetical protein  38.33 
 
 
122 aa  59.3  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0635046  hitchhiker  0.001286 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4168  hypothetical protein  38.21 
 
 
119 aa  52.8  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000529234  decreased coverage  0.00000158295 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4190  hypothetical protein  41.89 
 
 
110 aa  49.7  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.215857 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1888  hypothetical protein  32.77 
 
 
117 aa  49.3  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0081  hypothetical protein  39.34 
 
 
111 aa  47.8  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0127651 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2777  hypothetical protein  31.09 
 
 
124 aa  47.4  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5909  hypothetical protein  35.14 
 
 
128 aa  47.4  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1771  hypothetical protein  28.33 
 
 
119 aa  47  0.00008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.300159  normal  0.312594 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2262  hypothetical protein  35.48 
 
 
116 aa  45.8  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00019364 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1681  hypothetical protein  34 
 
 
116 aa  46.2  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000243963  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0279  hypothetical protein  29.66 
 
 
120 aa  44.3  0.0005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.457399  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0537  hypothetical protein  31.58 
 
 
115 aa  44.7  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1354  hypothetical protein  34.4 
 
 
133 aa  44.3  0.0006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.002337  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3433  hypothetical protein  29.76 
 
 
122 aa  42.4  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2091  hypothetical protein  29.2 
 
 
110 aa  42  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1800  hypothetical protein  37.7 
 
 
110 aa  41.6  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3039  hypothetical protein  32.08 
 
 
113 aa  40.8  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.54673  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2642  hypothetical protein  28.18 
 
 
117 aa  40.4  0.009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>