28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1815 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_1815  hypothetical protein  100 
 
 
125 aa  252  1.0000000000000001e-66  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.245824  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3291  hypothetical protein  41.67 
 
 
122 aa  97.4  5e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1637  hypothetical protein  42.5 
 
 
122 aa  94.4  5e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0635046  hitchhiker  0.001286 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1772  hypothetical protein  35.29 
 
 
122 aa  80.9  0.000000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.46345  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2494  hypothetical protein  36.13 
 
 
122 aa  77.8  0.00000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.255706 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0428  hypothetical protein  33.05 
 
 
125 aa  77  0.00000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2206  hypothetical protein  33.61 
 
 
120 aa  72.8  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000336434 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2486  hypothetical protein  35.9 
 
 
121 aa  70.9  0.000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0794808  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2504  hypothetical protein  26.89 
 
 
124 aa  69.7  0.00000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4898  hypothetical protein  36.45 
 
 
124 aa  67  0.00000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.135304  normal  0.116752 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4280  hypothetical protein  35.29 
 
 
115 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4084  hypothetical protein  34.17 
 
 
122 aa  63.5  0.0000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0440  hypothetical protein  34.17 
 
 
122 aa  60.5  0.000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.728055  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1771  hypothetical protein  32.81 
 
 
119 aa  59.7  0.00000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.300159  normal  0.312594 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1354  hypothetical protein  34.26 
 
 
133 aa  52.4  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.002337  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5909  hypothetical protein  36.63 
 
 
128 aa  50.8  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0170  hypothetical protein  30.25 
 
 
130 aa  48.9  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2777  hypothetical protein  27.12 
 
 
124 aa  48.1  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1237  hypothetical protein  32.93 
 
 
121 aa  48.1  0.00004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.106406  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1155  hypothetical protein  27.78 
 
 
116 aa  45.8  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0081  hypothetical protein  38.33 
 
 
111 aa  45.1  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0127651 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2262  hypothetical protein  38.6 
 
 
116 aa  44.3  0.0006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00019364 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2989  hypothetical protein  31.71 
 
 
111 aa  43.1  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.701309  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1681  hypothetical protein  24.3 
 
 
116 aa  43.5  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000243963  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0600  hypothetical protein  40 
 
 
118 aa  43.5  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0476447  normal  0.181324 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0895  hypothetical protein  30.26 
 
 
109 aa  41.2  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3433  hypothetical protein  28.87 
 
 
122 aa  41.6  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2181  hypothetical protein  32.76 
 
 
118 aa  40.8  0.006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.16221  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>