20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3433 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_3433  hypothetical protein  100 
 
 
122 aa  253  6e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1800  hypothetical protein  41.82 
 
 
110 aa  99  2e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0081  hypothetical protein  40 
 
 
111 aa  91.3  4e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0127651 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0895  hypothetical protein  40.91 
 
 
109 aa  90.1  9e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2091  hypothetical protein  39.25 
 
 
110 aa  88.2  4e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1889  hypothetical protein  36.7 
 
 
110 aa  81.3  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0499  hypothetical protein  33.03 
 
 
110 aa  80.5  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.200702  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1914  hypothetical protein  35.78 
 
 
110 aa  79  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0652972  normal  0.631226 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4190  hypothetical protein  37.36 
 
 
110 aa  74.3  0.0000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.215857 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4962  hypothetical protein  31.53 
 
 
111 aa  68.2  0.00000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3039  hypothetical protein  39.39 
 
 
113 aa  50.4  0.000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.54673  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2262  hypothetical protein  36.84 
 
 
116 aa  50.1  0.000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00019364 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2877  hypothetical protein  35 
 
 
113 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00521962  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1709  hypothetical protein  25.74 
 
 
114 aa  45.4  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0600  hypothetical protein  29.81 
 
 
118 aa  44.3  0.0006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0476447  normal  0.181324 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1637  hypothetical protein  29.46 
 
 
122 aa  43.1  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0635046  hitchhiker  0.001286 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1237  hypothetical protein  29.76 
 
 
121 aa  42.4  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.106406  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5087  hypothetical protein  29.03 
 
 
118 aa  41.6  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000115983  normal  0.14262 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1815  hypothetical protein  28.87 
 
 
125 aa  41.6  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.245824  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2196  hypothetical protein  26.03 
 
 
114 aa  40.8  0.006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>