14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_5087 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_5087  hypothetical protein  100 
 
 
118 aa  246  7e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000115983  normal  0.14262 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0532  hypothetical protein  45.28 
 
 
117 aa  88.6  3e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.330489  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2642  hypothetical protein  41.74 
 
 
117 aa  88.2  4e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0600  hypothetical protein  39.64 
 
 
118 aa  86.7  1e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0476447  normal  0.181324 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1368  hypothetical protein  35.42 
 
 
117 aa  81.3  0.000000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4512  hypothetical protein  39.39 
 
 
117 aa  79.3  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.90814 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0820  hypothetical protein  44.71 
 
 
110 aa  63.9  0.0000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0617234  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2091  hypothetical protein  32.73 
 
 
110 aa  55.5  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4190  hypothetical protein  28.83 
 
 
110 aa  48.1  0.00004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.215857 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3520  hypothetical protein  44.26 
 
 
124 aa  47.4  0.00007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000363684 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4962  hypothetical protein  26.8 
 
 
111 aa  44.3  0.0006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0499  hypothetical protein  34.48 
 
 
110 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.200702  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4618  hypothetical protein  27.71 
 
 
114 aa  42  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3433  hypothetical protein  29.03 
 
 
122 aa  41.6  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>