21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_4190 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_4190  hypothetical protein  100 
 
 		 110 aa  221  3e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.215857 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2091  hypothetical protein  50 
 
 		 110 aa  111  3e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1800  hypothetical protein  43.93 
 
 		 110 aa  96.3  1e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0081  hypothetical protein  44.04 
 
 		 111 aa  94  7e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0127651 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0499  hypothetical protein  43.16 
 
 		 110 aa  89  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.200702  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1889  hypothetical protein  39.09 
 
 		 110 aa  84.7  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1914  hypothetical protein  38.18 
 
 		 110 aa  83.2  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0652972  normal  0.631226 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3433  hypothetical protein  37.36 
 
 		 122 aa  74.3  0.0000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0895  hypothetical protein  40.66 
 
 		 109 aa  71.6  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4962  hypothetical protein  31.82 
 
 		 111 aa  62  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1709  hypothetical protein  32.46 
 
 		 114 aa  54.7  0.0000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2196  hypothetical protein  32.97 
 
 		 114 aa  51.6  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1237  hypothetical protein  41.89 
 
 		 121 aa  49.3  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.106406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3039  hypothetical protein  38.98 
 
 		 113 aa  48.5  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.54673  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5087  hypothetical protein  28.83 
 
 		 118 aa  48.1  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000115983  normal  0.14262 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0056  hypothetical protein  25.96 
 
 		 114 aa  43.9  0.0007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2877  hypothetical protein  35.59 
 
 		 113 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00521962  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4512  hypothetical protein  26.13 
 
 		 117 aa  42  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.90814 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4629  hypothetical protein  36.36 
 
 		 94 aa  41.6  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1985  hypothetical protein  37.1 
 
 		 111 aa  40.8  0.006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0440  hypothetical protein  34.18 
 
 		 122 aa  40.4  0.009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.728055  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>