22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_2091 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011901  Tgr7_2091  hypothetical protein  100 
 
 
110 aa  228  2e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4190  hypothetical protein  50 
 
 
110 aa  111  3e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.215857 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0895  hypothetical protein  46.79 
 
 
109 aa  103  8e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0499  hypothetical protein  43.88 
 
 
110 aa  98.2  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.200702  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1800  hypothetical protein  40.78 
 
 
110 aa  95.9  2e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0081  hypothetical protein  42.2 
 
 
111 aa  90.9  5e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0127651 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1889  hypothetical protein  38.18 
 
 
110 aa  89.4  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3433  hypothetical protein  39.25 
 
 
122 aa  88.2  4e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1914  hypothetical protein  37.27 
 
 
110 aa  87  7e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0652972  normal  0.631226 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4962  hypothetical protein  41.82 
 
 
111 aa  84.3  5e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5087  hypothetical protein  32.73 
 
 
118 aa  55.5  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000115983  normal  0.14262 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2196  hypothetical protein  32.89 
 
 
114 aa  54.7  0.0000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0056  hypothetical protein  30.48 
 
 
114 aa  53.5  0.0000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3039  hypothetical protein  33.72 
 
 
113 aa  53.5  0.0000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.54673  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1709  hypothetical protein  28.57 
 
 
114 aa  52.4  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1985  hypothetical protein  31.43 
 
 
111 aa  52.4  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2642  hypothetical protein  29.63 
 
 
117 aa  50.4  0.000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2877  hypothetical protein  37.33 
 
 
113 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00521962  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4618  hypothetical protein  42.86 
 
 
114 aa  48.9  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4629  hypothetical protein  38.46 
 
 
94 aa  47  0.00009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3291  hypothetical protein  31.19 
 
 
122 aa  44.7  0.0004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1637  hypothetical protein  45 
 
 
122 aa  43.1  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0635046  hitchhiker  0.001286 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>