19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_3039 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_3039  hypothetical protein  100 
 
 
113 aa  226  8e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.54673  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2877  hypothetical protein  71.43 
 
 
113 aa  168  2e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00521962  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1985  hypothetical protein  68.81 
 
 
111 aa  152  2e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2196  hypothetical protein  50.46 
 
 
114 aa  119  9.999999999999999e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1709  hypothetical protein  51.85 
 
 
114 aa  118  3e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0056  hypothetical protein  48.18 
 
 
114 aa  115  1.9999999999999998e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1800  hypothetical protein  32.67 
 
 
110 aa  57.8  0.00000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1889  hypothetical protein  35.05 
 
 
110 aa  56.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2091  hypothetical protein  33.72 
 
 
110 aa  53.5  0.0000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1914  hypothetical protein  34.02 
 
 
110 aa  53.5  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0652972  normal  0.631226 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0895  hypothetical protein  34.67 
 
 
109 aa  53.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0081  hypothetical protein  38.98 
 
 
111 aa  51.6  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0127651 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3433  hypothetical protein  39.39 
 
 
122 aa  50.4  0.000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0499  hypothetical protein  38.98 
 
 
110 aa  50.4  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.200702  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4190  hypothetical protein  38.98 
 
 
110 aa  48.5  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.215857 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2206  hypothetical protein  32.32 
 
 
120 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000336434 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4512  hypothetical protein  30.69 
 
 
117 aa  47  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.90814 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4962  hypothetical protein  32.08 
 
 
111 aa  44.3  0.0006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2642  hypothetical protein  28.97 
 
 
117 aa  43.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>