20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_0895 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_0895  hypothetical protein  100 
 
 		 109 aa  226  7e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1800  hypothetical protein  47.52 
 
 		 110 aa  104  3e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2091  hypothetical protein  46.79 
 
 		 110 aa  103  8e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0081  hypothetical protein  44.55 
 
 		 111 aa  97.4  6e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0127651 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0499  hypothetical protein  43.43 
 
 		 110 aa  91.3  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.200702  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3433  hypothetical protein  40.91 
 
 		 122 aa  90.1  8e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1889  hypothetical protein  46.07 
 
 		 110 aa  86.7  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1914  hypothetical protein  44.94 
 
 		 110 aa  84  6e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0652972  normal  0.631226 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4962  hypothetical protein  39.64 
 
 		 111 aa  82.8  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4190  hypothetical protein  40.66 
 
 		 110 aa  71.6  0.000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.215857 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3039  hypothetical protein  34.67 
 
 		 113 aa  53.5  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.54673  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4618  hypothetical protein  33.68 
 
 		 114 aa  50.8  0.000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0440  hypothetical protein  32.5 
 
 		 122 aa  48.9  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.728055  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2877  hypothetical protein  28.89 
 
 		 113 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00521962  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4084  hypothetical protein  32.5 
 
 		 122 aa  48.5  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1985  hypothetical protein  35 
 
 		 111 aa  47  0.00008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4629  hypothetical protein  52.38 
 
 		 94 aa  46.6  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1709  hypothetical protein  30 
 
 		 114 aa  43.9  0.0007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2196  hypothetical protein  38.78 
 
 		 114 aa  43.9  0.0008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1815  hypothetical protein  30.26 
 
 		 125 aa  41.2  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.245824  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>