12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4629 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_4629  hypothetical protein  100 
 
 
94 aa  195  2.0000000000000003e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4618  hypothetical protein  61.33 
 
 
114 aa  101  4e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0499  hypothetical protein  41.07 
 
 
110 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.200702  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2091  hypothetical protein  38.46 
 
 
110 aa  47  0.00008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0895  hypothetical protein  52.38 
 
 
109 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4962  hypothetical protein  40.38 
 
 
111 aa  45.8  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1889  hypothetical protein  37.29 
 
 
110 aa  44.7  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1210  hypothetical protein  40.48 
 
 
55 aa  42.4  0.002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000020177 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1914  hypothetical protein  35.59 
 
 
110 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0652972  normal  0.631226 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4190  hypothetical protein  36.36 
 
 
110 aa  41.6  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.215857 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1800  hypothetical protein  34.62 
 
 
110 aa  41.6  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4512  hypothetical protein  32.61 
 
 
117 aa  40  0.009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.90814 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>