16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4618 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_4618  hypothetical protein  100 
 
 
114 aa  237  4e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4629  hypothetical protein  61.33 
 
 
94 aa  101  4e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1889  hypothetical protein  33.33 
 
 
110 aa  51.2  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0895  hypothetical protein  33.68 
 
 
109 aa  50.8  0.000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1368  hypothetical protein  30.56 
 
 
117 aa  50.1  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0499  hypothetical protein  37.18 
 
 
110 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.200702  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1800  hypothetical protein  30.68 
 
 
110 aa  49.7  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2091  hypothetical protein  42.86 
 
 
110 aa  48.9  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2642  hypothetical protein  32.69 
 
 
117 aa  48.5  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1914  hypothetical protein  32.18 
 
 
110 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0652972  normal  0.631226 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4962  hypothetical protein  31.82 
 
 
111 aa  47.4  0.00006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1210  hypothetical protein  50 
 
 
55 aa  46.2  0.0001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000020177 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0081  hypothetical protein  46.81 
 
 
111 aa  44.7  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0127651 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5087  hypothetical protein  27.71 
 
 
118 aa  42  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000115983  normal  0.14262 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0600  hypothetical protein  24.76 
 
 
118 aa  40.4  0.008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0476447  normal  0.181324 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0532  hypothetical protein  24.11 
 
 
117 aa  40.4  0.009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.330489  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>