17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_1368 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_1368  hypothetical protein  100 
 
 		 117 aa  239  7.999999999999999e-63  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2642  hypothetical protein  56.41 
 
 		 117 aa  138  3e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0600  hypothetical protein  44.83 
 
 		 118 aa  108  3e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0476447  normal  0.181324 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0532  hypothetical protein  43.97 
 
 		 117 aa  108  3e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.330489  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4512  hypothetical protein  35.9 
 
 		 117 aa  94.7  4e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.90814 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0820  hypothetical protein  47.06 
 
 		 110 aa  86.3  1e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0617234  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5087  hypothetical protein  35.42 
 
 		 118 aa  81.3  0.000000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000115983  normal  0.14262 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3520  hypothetical protein  35.71 
 
 		 124 aa  55.5  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000363684 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4618  hypothetical protein  30.56 
 
 		 114 aa  50.1  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2504  hypothetical protein  42.37 
 
 		 124 aa  48.9  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0440  hypothetical protein  35 
 
 		 122 aa  43.9  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.728055  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1354  hypothetical protein  35.71 
 
 		 133 aa  43.1  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.002337  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2206  hypothetical protein  37.5 
 
 		 120 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000336434 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2181  hypothetical protein  35.62 
 
 		 118 aa  42.7  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.16221  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1772  hypothetical protein  29.17 
 
 		 122 aa  42  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.46345  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2262  hypothetical protein  38.98 
 
 		 116 aa  41.6  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00019364 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4084  hypothetical protein  32.5 
 
 		 122 aa  41.6  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>