35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0440 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_0440  hypothetical protein  100 
 
 		 122 aa  237  4e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.728055  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4084  hypothetical protein  95.08 
 
 		 122 aa  199  9.999999999999999e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2206  hypothetical protein  39.67 
 
 		 120 aa  80.5  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000336434 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2504  hypothetical protein  36.36 
 
 		 124 aa  78.6  0.00000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2486  hypothetical protein  35.29 
 
 		 121 aa  75.1  0.0000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0794808  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1815  hypothetical protein  34.17 
 
 		 125 aa  70.9  0.000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.245824  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2494  hypothetical protein  33.61 
 
 		 122 aa  68.9  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.255706 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4898  hypothetical protein  34.86 
 
 		 124 aa  68.6  0.00000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.135304  normal  0.116752 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3291  hypothetical protein  33.88 
 
 		 122 aa  66.6  0.0000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1772  hypothetical protein  32.52 
 
 		 122 aa  63.2  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.46345  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1237  hypothetical protein  41.38 
 
 		 121 aa  62.8  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.106406  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0428  hypothetical protein  33.06 
 
 		 125 aa  62  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0532  hypothetical protein  35.04 
 
 		 117 aa  61.6  0.000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.330489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1637  hypothetical protein  37.7 
 
 		 122 aa  58.9  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0635046  hitchhiker  0.001286 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5909  hypothetical protein  33.33 
 
 		 128 aa  57.8  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0600  hypothetical protein  36.73 
 
 		 118 aa  55.5  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0476447  normal  0.181324 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0895  hypothetical protein  32.11 
 
 		 109 aa  55.1  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2642  hypothetical protein  30.97 
 
 		 117 aa  50.4  0.000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1888  hypothetical protein  34.07 
 
 		 117 aa  50.1  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0081  hypothetical protein  35.96 
 
 		 111 aa  49.7  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0127651 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1889  hypothetical protein  34.18 
 
 		 110 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4280  hypothetical protein  31.25 
 
 		 115 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0170  hypothetical protein  26.5 
 
 		 130 aa  49.3  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1914  hypothetical protein  34.21 
 
 		 110 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0652972  normal  0.631226 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6320  hypothetical protein  37.5 
 
 		 120 aa  47.8  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1800  hypothetical protein  35.44 
 
 		 110 aa  46.2  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6242  hypothetical protein  39.13 
 
 		 120 aa  45.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.166665  normal  0.0804167 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0499  hypothetical protein  34.18 
 
 		 110 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.200702  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1368  hypothetical protein  35 
 
 		 117 aa  44.3  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2515  hypothetical protein  35 
 
 		 116 aa  44.3  0.0006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.172015  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1771  hypothetical protein  30.08 
 
 		 119 aa  42.7  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.300159  normal  0.312594 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0279  hypothetical protein  29.41 
 
 		 120 aa  42  0.003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.457399  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1354  hypothetical protein  30.7 
 
 		 133 aa  41.6  0.004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.002337  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2091  hypothetical protein  27.52 
 
 		 110 aa  41.2  0.005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2181  hypothetical protein  34.67 
 
 		 118 aa  40.4  0.008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.16221  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>