32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1637 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_1637  hypothetical protein  100 
 
 
122 aa  234  2e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0635046  hitchhiker  0.001286 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3291  hypothetical protein  52.89 
 
 
122 aa  112  2.0000000000000002e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1815  hypothetical protein  42.5 
 
 
125 aa  102  2e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.245824  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2206  hypothetical protein  38.33 
 
 
120 aa  75.5  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000336434 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1772  hypothetical protein  36.67 
 
 
122 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.46345  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2494  hypothetical protein  35.83 
 
 
122 aa  71.6  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.255706 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0428  hypothetical protein  32.5 
 
 
125 aa  64.3  0.0000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2504  hypothetical protein  30.83 
 
 
124 aa  64.3  0.0000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0440  hypothetical protein  37.7 
 
 
122 aa  61.6  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.728055  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4084  hypothetical protein  38.52 
 
 
122 aa  61.6  0.000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2486  hypothetical protein  31.09 
 
 
121 aa  58.2  0.00000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0794808  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1771  hypothetical protein  31.71 
 
 
119 aa  56.2  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.300159  normal  0.312594 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4898  hypothetical protein  32.41 
 
 
124 aa  54.7  0.0000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.135304  normal  0.116752 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4280  hypothetical protein  32.04 
 
 
115 aa  51.2  0.000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1237  hypothetical protein  39.29 
 
 
121 aa  50.8  0.000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.106406  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2091  hypothetical protein  39.33 
 
 
110 aa  49.7  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5909  hypothetical protein  29.67 
 
 
128 aa  48.1  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1155  hypothetical protein  27.12 
 
 
116 aa  47  0.00009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2989  hypothetical protein  44.07 
 
 
111 aa  45.8  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.701309  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3433  hypothetical protein  29.46 
 
 
122 aa  45.8  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0170  hypothetical protein  26.96 
 
 
130 aa  46.2  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2642  hypothetical protein  45 
 
 
117 aa  44.7  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1914  hypothetical protein  33.71 
 
 
110 aa  43.5  0.0009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0652972  normal  0.631226 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0895  hypothetical protein  33.7 
 
 
109 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0600  hypothetical protein  45 
 
 
118 aa  43.5  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0476447  normal  0.181324 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1889  hypothetical protein  33.71 
 
 
110 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0499  hypothetical protein  31.58 
 
 
110 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.200702  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1888  hypothetical protein  35.14 
 
 
117 aa  41.6  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1354  hypothetical protein  30.71 
 
 
133 aa  41.6  0.004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.002337  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0081  hypothetical protein  34.62 
 
 
111 aa  40.8  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0127651 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1681  hypothetical protein  24.75 
 
 
116 aa  40.4  0.009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000243963  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4168  hypothetical protein  34.19 
 
 
119 aa  40.4  0.009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000529234  decreased coverage  0.00000158295 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>