32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_4084 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_4084  hypothetical protein  100 
 
 		 122 aa  239  1e-62  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0440  hypothetical protein  95.08 
 
 		 122 aa  195  1.0000000000000001e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.728055  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2206  hypothetical protein  37.19 
 
 		 120 aa  75.5  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000336434 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3291  hypothetical protein  36.36 
 
 		 122 aa  75.5  0.0000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2486  hypothetical protein  33.61 
 
 		 121 aa  71.6  0.000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0794808  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2494  hypothetical protein  34.43 
 
 		 122 aa  71.2  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.255706 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2504  hypothetical protein  33.06 
 
 		 124 aa  71.6  0.000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1815  hypothetical protein  34.17 
 
 		 125 aa  71.2  0.000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.245824  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1772  hypothetical protein  32.52 
 
 		 122 aa  65.1  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.46345  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4898  hypothetical protein  33.03 
 
 		 124 aa  64.7  0.0000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.135304  normal  0.116752 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0428  hypothetical protein  35.29 
 
 		 125 aa  63.2  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1637  hypothetical protein  38.52 
 
 		 122 aa  57.4  0.00000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0635046  hitchhiker  0.001286 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1237  hypothetical protein  37.93 
 
 		 121 aa  57.4  0.00000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.106406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0532  hypothetical protein  32.48 
 
 		 117 aa  55.8  0.0000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.330489  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5909  hypothetical protein  33.33 
 
 		 128 aa  55.8  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0895  hypothetical protein  32.11 
 
 		 109 aa  52.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0081  hypothetical protein  37.08 
 
 		 111 aa  50.4  0.000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0127651 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4280  hypothetical protein  32.14 
 
 		 115 aa  50.4  0.000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1889  hypothetical protein  34.18 
 
 		 110 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2642  hypothetical protein  30.09 
 
 		 117 aa  49.7  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0600  hypothetical protein  31.3 
 
 		 118 aa  49.7  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0476447  normal  0.181324 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1914  hypothetical protein  34.21 
 
 		 110 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0652972  normal  0.631226 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1800  hypothetical protein  30.63 
 
 		 110 aa  47.4  0.00007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0499  hypothetical protein  35.44 
 
 		 110 aa  47.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.200702  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6320  hypothetical protein  35 
 
 		 120 aa  45.8  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0170  hypothetical protein  25.64 
 
 		 130 aa  45.4  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1888  hypothetical protein  31.87 
 
 		 117 aa  44.7  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1771  hypothetical protein  30.08 
 
 		 119 aa  43.5  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.300159  normal  0.312594 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2091  hypothetical protein  29.36 
 
 		 110 aa  43.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1368  hypothetical protein  32.5 
 
 		 117 aa  41.6  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2515  hypothetical protein  33.75 
 
 		 116 aa  41.2  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.172015  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4190  hypothetical protein  32.38 
 
 		 110 aa  40.8  0.007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.215857 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>