15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6320 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_6320  hypothetical protein  100 
 
 
120 aa  236  6.999999999999999e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0387  hypothetical protein  89.61 
 
 
136 aa  138  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0170  hypothetical protein  32.76 
 
 
130 aa  82.8  0.000000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1888  hypothetical protein  35 
 
 
117 aa  55.8  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2504  hypothetical protein  29.06 
 
 
124 aa  51.2  0.000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0440  hypothetical protein  37.5 
 
 
122 aa  48.1  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.728055  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4084  hypothetical protein  35 
 
 
122 aa  45.8  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2515  hypothetical protein  31.37 
 
 
116 aa  44.7  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.172015  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0537  hypothetical protein  31.18 
 
 
115 aa  43.1  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1771  hypothetical protein  27.05 
 
 
119 aa  42  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.300159  normal  0.312594 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2206  hypothetical protein  26.5 
 
 
120 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000336434 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1681  hypothetical protein  30.65 
 
 
116 aa  41.6  0.004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000243963  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1155  hypothetical protein  28.21 
 
 
116 aa  41.6  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2181  hypothetical protein  37.33 
 
 
118 aa  41.2  0.005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.16221  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2777  hypothetical protein  28.21 
 
 
124 aa  40.8  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>