21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2777 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_2777  hypothetical protein  100 
 
 
124 aa  253  7e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2206  hypothetical protein  29.41 
 
 
120 aa  57.8  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000336434 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0428  hypothetical protein  26.05 
 
 
125 aa  51.2  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1771  hypothetical protein  31.15 
 
 
119 aa  50.8  0.000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.300159  normal  0.312594 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1914  hypothetical protein  29.55 
 
 
110 aa  50.4  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0652972  normal  0.631226 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0081  hypothetical protein  31.52 
 
 
111 aa  50.1  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0127651 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2504  hypothetical protein  28.57 
 
 
124 aa  48.5  0.00003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1889  hypothetical protein  28.41 
 
 
110 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1815  hypothetical protein  27.12 
 
 
125 aa  48.1  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.245824  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0537  hypothetical protein  32.2 
 
 
115 aa  48.1  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1354  hypothetical protein  28.81 
 
 
133 aa  46.6  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.002337  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4168  hypothetical protein  33.33 
 
 
119 aa  46.6  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000529234  decreased coverage  0.00000158295 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0279  hypothetical protein  28.93 
 
 
120 aa  45.4  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.457399  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1681  hypothetical protein  26.67 
 
 
116 aa  44.7  0.0004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000243963  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4280  hypothetical protein  29.25 
 
 
115 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1772  hypothetical protein  28.1 
 
 
122 aa  43.9  0.0008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.46345  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3291  hypothetical protein  28.57 
 
 
122 aa  42  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1888  hypothetical protein  29.41 
 
 
117 aa  41.2  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5909  hypothetical protein  35 
 
 
128 aa  41.2  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6320  hypothetical protein  28.21 
 
 
120 aa  40.8  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1237  hypothetical protein  35.48 
 
 
121 aa  40.8  0.007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.106406  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>