18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_0279 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013385  Adeg_0279  hypothetical protein  100 
 
 
120 aa  243  9e-64  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.457399  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0696  hypothetical protein  60.34 
 
 
119 aa  130  3.9999999999999996e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0776606  normal  0.728055 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1888  hypothetical protein  40.17 
 
 
117 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1771  hypothetical protein  37.19 
 
 
119 aa  72.8  0.000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.300159  normal  0.312594 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0537  hypothetical protein  33.91 
 
 
115 aa  73.2  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2515  hypothetical protein  33.63 
 
 
116 aa  72.8  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.172015  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5532  hypothetical protein  28.95 
 
 
116 aa  62  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.134306 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1155  hypothetical protein  31.62 
 
 
116 aa  57.8  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1354  hypothetical protein  33.33 
 
 
133 aa  57.4  0.00000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.002337  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1772  hypothetical protein  29.66 
 
 
122 aa  54.7  0.0000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.46345  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0170  hypothetical protein  30 
 
 
130 aa  49.3  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4168  hypothetical protein  29.82 
 
 
119 aa  49.3  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000529234  decreased coverage  0.00000158295 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2777  hypothetical protein  28.93 
 
 
124 aa  45.4  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2206  hypothetical protein  37.04 
 
 
120 aa  44.7  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000336434 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5909  hypothetical protein  32.86 
 
 
128 aa  44.7  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0428  hypothetical protein  29.31 
 
 
125 aa  44.3  0.0006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2504  hypothetical protein  28.69 
 
 
124 aa  43.1  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1237  hypothetical protein  32.53 
 
 
121 aa  40.4  0.009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.106406  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>