30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5909 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_5909  hypothetical protein  100 
 
 		 128 aa  255  1e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0440  hypothetical protein  33.33 
 
 		 122 aa  57.4  0.00000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.728055  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2504  hypothetical protein  40.54 
 
 		 124 aa  56.2  0.0000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0428  hypothetical protein  36.84 
 
 		 125 aa  56.2  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4084  hypothetical protein  33.33 
 
 		 122 aa  55.5  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1815  hypothetical protein  36.63 
 
 		 125 aa  50.8  0.000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.245824  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2515  hypothetical protein  30 
 
 		 116 aa  49.7  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.172015  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4898  hypothetical protein  36.49 
 
 		 124 aa  49.3  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.135304  normal  0.116752 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1888  hypothetical protein  39.39 
 
 		 117 aa  48.9  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1354  hypothetical protein  34.72 
 
 		 133 aa  48.5  0.00003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.002337  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2494  hypothetical protein  32.97 
 
 		 122 aa  48.1  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.255706 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1771  hypothetical protein  34.48 
 
 		 119 aa  47.8  0.00005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.300159  normal  0.312594 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1155  hypothetical protein  34.83 
 
 		 116 aa  47  0.00008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1237  hypothetical protein  35.14 
 
 		 121 aa  47  0.00009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.106406  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1889  hypothetical protein  34.62 
 
 		 110 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2206  hypothetical protein  34.21 
 
 		 120 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000336434 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1681  hypothetical protein  32.84 
 
 		 116 aa  46.6  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000243963  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1772  hypothetical protein  36 
 
 		 122 aa  46.6  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.46345  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1637  hypothetical protein  29.03 
 
 		 122 aa  46.6  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0635046  hitchhiker  0.001286 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0537  hypothetical protein  31.87 
 
 		 115 aa  46.2  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2486  hypothetical protein  34.25 
 
 		 121 aa  45.4  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0794808  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0279  hypothetical protein  32.86 
 
 		 120 aa  44.7  0.0004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.457399  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1914  hypothetical protein  33.65 
 
 		 110 aa  44.7  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0652972  normal  0.631226 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2989  hypothetical protein  40.35 
 
 		 111 aa  44.3  0.0006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.701309  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4931  hypothetical protein  34.15 
 
 		 108 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0903429  normal  0.748004 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0696  hypothetical protein  27.54 
 
 		 119 aa  43.5  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0776606  normal  0.728055 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4280  hypothetical protein  26.36 
 
 		 115 aa  42.4  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0081  hypothetical protein  36.84 
 
 		 111 aa  41.2  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0127651 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2777  hypothetical protein  35 
 
 		 124 aa  41.2  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5532  hypothetical protein  31.08 
 
 		 116 aa  40.4  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.134306 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>