23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_4898 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_4898  hypothetical protein  100 
 
 
124 aa  251  2.0000000000000002e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.135304  normal  0.116752 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2486  hypothetical protein  96.69 
 
 
121 aa  239  1e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0794808  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2494  hypothetical protein  50.41 
 
 
122 aa  135  1e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.255706 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4280  hypothetical protein  44.64 
 
 
115 aa  90.1  9e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1237  hypothetical protein  47.73 
 
 
121 aa  89  2e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.106406  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0428  hypothetical protein  36.67 
 
 
125 aa  80.1  0.00000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1772  hypothetical protein  30.83 
 
 
122 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.46345  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1815  hypothetical protein  36.13 
 
 
125 aa  73.2  0.000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.245824  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0440  hypothetical protein  35.25 
 
 
122 aa  73.2  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.728055  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4084  hypothetical protein  33.61 
 
 
122 aa  70.1  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2206  hypothetical protein  33.33 
 
 
120 aa  64.7  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000336434 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2504  hypothetical protein  28.33 
 
 
124 aa  62.8  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3291  hypothetical protein  33.33 
 
 
122 aa  62  0.000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1637  hypothetical protein  33.33 
 
 
122 aa  57.8  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0635046  hitchhiker  0.001286 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5909  hypothetical protein  36.49 
 
 
128 aa  49.3  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1914  hypothetical protein  35.29 
 
 
110 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0652972  normal  0.631226 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1889  hypothetical protein  35.29 
 
 
110 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0081  hypothetical protein  39.34 
 
 
111 aa  45.1  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0127651 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1771  hypothetical protein  29.51 
 
 
119 aa  44.7  0.0004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.300159  normal  0.312594 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0499  hypothetical protein  30.59 
 
 
110 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.200702  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1800  hypothetical protein  32.67 
 
 
110 aa  43.5  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2777  hypothetical protein  23.53 
 
 
124 aa  41.6  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3433  hypothetical protein  26.89 
 
 
122 aa  40  0.01  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>