20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_4280 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_4280  hypothetical protein  100 
 
 		 115 aa  228  2e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2494  hypothetical protein  44.64 
 
 		 122 aa  94.4  4e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.255706 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2486  hypothetical protein  44.64 
 
 		 121 aa  90.1  9e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0794808  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4898  hypothetical protein  43.69 
 
 		 124 aa  82.4  0.000000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.135304  normal  0.116752 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1772  hypothetical protein  39.29 
 
 		 122 aa  80.1  0.000000000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.46345  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0428  hypothetical protein  37.5 
 
 		 125 aa  72  0.000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1237  hypothetical protein  48.57 
 
 		 121 aa  67.4  0.00000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.106406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1815  hypothetical protein  35.29 
 
 		 125 aa  66.6  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.245824  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2206  hypothetical protein  33.93 
 
 		 120 aa  62.4  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000336434 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2504  hypothetical protein  29.46 
 
 		 124 aa  57.4  0.00000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4168  hypothetical protein  37.11 
 
 		 119 aa  54.3  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000529234  decreased coverage  0.00000158295 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1354  hypothetical protein  33.65 
 
 		 133 aa  48.1  0.00003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.002337  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3291  hypothetical protein  31.52 
 
 		 122 aa  47.4  0.00007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0440  hypothetical protein  37.14 
 
 		 122 aa  45.1  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.728055  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1637  hypothetical protein  32.04 
 
 		 122 aa  45.1  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0635046  hitchhiker  0.001286 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4084  hypothetical protein  32.14 
 
 		 122 aa  45.4  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2777  hypothetical protein  29.25 
 
 		 124 aa  43.9  0.0007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1681  hypothetical protein  30.77 
 
 		 116 aa  43.1  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000243963  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1771  hypothetical protein  31.03 
 
 		 119 aa  42.7  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.300159  normal  0.312594 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5909  hypothetical protein  26.36 
 
 		 128 aa  42.4  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>