16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_2486 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_2486  hypothetical protein  100 
 
 
121 aa  248  3e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0794808  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4898  hypothetical protein  97.22 
 
 
124 aa  215  1e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.135304  normal  0.116752 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2494  hypothetical protein  50 
 
 
122 aa  131  3e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.255706 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4280  hypothetical protein  44.64 
 
 
115 aa  90.1  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1237  hypothetical protein  45.88 
 
 
121 aa  84.3  5e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.106406  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0428  hypothetical protein  35.9 
 
 
125 aa  77.8  0.00000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1772  hypothetical protein  29.91 
 
 
122 aa  71.6  0.000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.46345  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0440  hypothetical protein  35.29 
 
 
122 aa  70.9  0.000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.728055  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1815  hypothetical protein  35.9 
 
 
125 aa  70.9  0.000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.245824  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4084  hypothetical protein  33.61 
 
 
122 aa  67.8  0.00000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2206  hypothetical protein  31.62 
 
 
120 aa  59.7  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000336434 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2504  hypothetical protein  27.35 
 
 
124 aa  58.5  0.00000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3291  hypothetical protein  30.77 
 
 
122 aa  57  0.00000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1637  hypothetical protein  31.09 
 
 
122 aa  53.9  0.0000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0635046  hitchhiker  0.001286 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5909  hypothetical protein  34.25 
 
 
128 aa  45.4  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0081  hypothetical protein  36.21 
 
 
111 aa  40  0.01  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0127651 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>