30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1772 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1772  hypothetical protein  100 
 
 		 122 aa  244  3e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.46345  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2504  hypothetical protein  49.17 
 
 		 124 aa  113  7.999999999999999e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2206  hypothetical protein  50 
 
 		 120 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000336434 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0428  hypothetical protein  43.8 
 
 		 125 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1815  hypothetical protein  35.29 
 
 		 125 aa  80.9  0.000000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.245824  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4280  hypothetical protein  39.29 
 
 		 115 aa  80.1  0.000000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2494  hypothetical protein  32.5 
 
 		 122 aa  77  0.00000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.255706 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2486  hypothetical protein  29.91 
 
 		 121 aa  71.6  0.000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0794808  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4898  hypothetical protein  29.63 
 
 		 124 aa  68.9  0.00000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.135304  normal  0.116752 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1637  hypothetical protein  36.67 
 
 		 122 aa  69.3  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0635046  hitchhiker  0.001286 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1237  hypothetical protein  42.17 
 
 		 121 aa  68.6  0.00000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.106406  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1354  hypothetical protein  33.03 
 
 		 133 aa  63.2  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.002337  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4084  hypothetical protein  31.4 
 
 		 122 aa  61.6  0.000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0440  hypothetical protein  32.52 
 
 		 122 aa  60.1  0.000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.728055  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3291  hypothetical protein  28.69 
 
 		 122 aa  59.7  0.00000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1771  hypothetical protein  31.97 
 
 		 119 aa  59.7  0.00000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.300159  normal  0.312594 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0279  hypothetical protein  29.66 
 
 		 120 aa  54.7  0.0000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.457399  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1155  hypothetical protein  38.71 
 
 		 116 aa  54.3  0.0000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2515  hypothetical protein  31.3 
 
 		 116 aa  53.5  0.0000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.172015  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0537  hypothetical protein  33.04 
 
 		 115 aa  53.5  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1888  hypothetical protein  31.67 
 
 		 117 aa  53.1  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4168  hypothetical protein  32.76 
 
 		 119 aa  52.4  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000529234  decreased coverage  0.00000158295 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0532  hypothetical protein  42.42 
 
 		 117 aa  48.1  0.00004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.330489  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0600  hypothetical protein  42.37 
 
 		 118 aa  47  0.00009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0476447  normal  0.181324 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5909  hypothetical protein  36 
 
 		 128 aa  46.6  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0696  hypothetical protein  35.37 
 
 		 119 aa  45.8  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0776606  normal  0.728055 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0170  hypothetical protein  25.64 
 
 		 130 aa  45.8  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2777  hypothetical protein  28.1 
 
 		 124 aa  43.9  0.0008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1368  hypothetical protein  29.17 
 
 		 117 aa  42  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2642  hypothetical protein  30.21 
 
 		 117 aa  40  0.01  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>