14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1155 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_1155  hypothetical protein  100 
 
 
116 aa  238  2.9999999999999997e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1888  hypothetical protein  41.74 
 
 
117 aa  93.6  8e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1771  hypothetical protein  37.72 
 
 
119 aa  79.3  0.00000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.300159  normal  0.312594 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0279  hypothetical protein  31.62 
 
 
120 aa  57.8  0.00000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.457399  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1772  hypothetical protein  38.71 
 
 
122 aa  54.3  0.0000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.46345  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0428  hypothetical protein  29.82 
 
 
125 aa  50.1  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0696  hypothetical protein  30.77 
 
 
119 aa  48.5  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0776606  normal  0.728055 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5909  hypothetical protein  34.83 
 
 
128 aa  47  0.00008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0537  hypothetical protein  30.09 
 
 
115 aa  47  0.00009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1815  hypothetical protein  27.78 
 
 
125 aa  45.8  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.245824  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1637  hypothetical protein  28.04 
 
 
122 aa  43.5  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0635046  hitchhiker  0.001286 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2515  hypothetical protein  25.89 
 
 
116 aa  42.7  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.172015  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6320  hypothetical protein  28.21 
 
 
120 aa  41.6  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5532  hypothetical protein  28.32 
 
 
116 aa  41.6  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.134306 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>