19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0537 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_0537  hypothetical protein  100 
 
 
115 aa  233  5.0000000000000005e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2515  hypothetical protein  70.43 
 
 
116 aa  173  8e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.172015  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0279  hypothetical protein  33.91 
 
 
120 aa  73.2  0.000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.457399  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1354  hypothetical protein  34.82 
 
 
133 aa  60.8  0.000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.002337  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1888  hypothetical protein  31.86 
 
 
117 aa  55.1  0.0000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2504  hypothetical protein  32.17 
 
 
124 aa  53.5  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1772  hypothetical protein  33.04 
 
 
122 aa  53.5  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.46345  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0696  hypothetical protein  32.08 
 
 
119 aa  50.1  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0776606  normal  0.728055 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4168  hypothetical protein  32.41 
 
 
119 aa  49.3  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000529234  decreased coverage  0.00000158295 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1771  hypothetical protein  38.46 
 
 
119 aa  49.3  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.300159  normal  0.312594 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2777  hypothetical protein  32.2 
 
 
124 aa  48.1  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1155  hypothetical protein  30.09 
 
 
116 aa  47  0.00009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5909  hypothetical protein  31.87 
 
 
128 aa  46.2  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5532  hypothetical protein  27.27 
 
 
116 aa  47  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.134306 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2989  hypothetical protein  32.67 
 
 
111 aa  44.7  0.0004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.701309  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1681  hypothetical protein  32.91 
 
 
116 aa  43.1  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000243963  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6320  hypothetical protein  31.18 
 
 
120 aa  43.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0675  hypothetical protein  25.22 
 
 
130 aa  41.6  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.739735  normal  0.351726 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6242  hypothetical protein  36.11 
 
 
120 aa  41.2  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.166665  normal  0.0804167 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>