18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_0675 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_0675  hypothetical protein  100 
 
 
130 aa  268  2e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.739735  normal  0.351726 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1363  hypothetical protein  53.6 
 
 
130 aa  134  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5309  hypothetical protein  43.93 
 
 
113 aa  96.7  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2356  hypothetical protein  40.71 
 
 
112 aa  88.2  3e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.179606  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0901  hypothetical protein  56.34 
 
 
85 aa  88.2  4e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  unclonable  0.0000132219 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3905  hypothetical protein  53.09 
 
 
103 aa  87  7e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3762  hypothetical protein  48.1 
 
 
113 aa  82  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000079403  normal  0.0464919 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1941  hypothetical protein  50 
 
 
85 aa  63.5  0.0000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0868  hypothetical protein  40.74 
 
 
119 aa  57  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.213532 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6242  hypothetical protein  33.98 
 
 
120 aa  47.8  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.166665  normal  0.0804167 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0522  hypothetical protein  29.59 
 
 
121 aa  45.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0123938  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1888  hypothetical protein  34.57 
 
 
117 aa  44.7  0.0005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2989  hypothetical protein  32.47 
 
 
111 aa  42.7  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.701309  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0170  hypothetical protein  32.5 
 
 
130 aa  42  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2515  hypothetical protein  25.86 
 
 
116 aa  41.6  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.172015  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0537  hypothetical protein  25.22 
 
 
115 aa  41.6  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4521  hypothetical protein  39.76 
 
 
102 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000119518  normal  0.999425 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4593  hypothetical protein  34 
 
 
109 aa  41.2  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.781109  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>