17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_5309 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_5309  hypothetical protein  100 
 
 
113 aa  234  2e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3762  hypothetical protein  57.52 
 
 
113 aa  127  4.0000000000000003e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000079403  normal  0.0464919 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3905  hypothetical protein  64.21 
 
 
103 aa  127  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2356  hypothetical protein  55.45 
 
 
112 aa  127  7.000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.179606  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1363  hypothetical protein  48.65 
 
 
130 aa  114  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0675  hypothetical protein  43.93 
 
 
130 aa  96.7  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.739735  normal  0.351726 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0901  hypothetical protein  54.79 
 
 
85 aa  90.9  6e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  unclonable  0.0000132219 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1941  hypothetical protein  56.67 
 
 
85 aa  74.7  0.0000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6242  hypothetical protein  35.78 
 
 
120 aa  58.5  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.166665  normal  0.0804167 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4521  hypothetical protein  38.3 
 
 
102 aa  50.8  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000119518  normal  0.999425 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4593  hypothetical protein  44.12 
 
 
109 aa  48.5  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.781109  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0868  hypothetical protein  39.13 
 
 
119 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.213532 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0522  hypothetical protein  34.52 
 
 
121 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0123938  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3727  hypothetical protein  35.06 
 
 
117 aa  43.1  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2206  hypothetical protein  41.27 
 
 
120 aa  40.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000336434 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1888  hypothetical protein  33.77 
 
 
117 aa  40.4  0.009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4931  hypothetical protein  34.88 
 
 
108 aa  40  0.01  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0903429  normal  0.748004 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>