16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_3762 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_3762  hypothetical protein  100 
 
 
113 aa  230  5e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000079403  normal  0.0464919 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5309  hypothetical protein  57.52 
 
 
113 aa  127  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3905  hypothetical protein  63.16 
 
 
103 aa  120  5e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2356  hypothetical protein  54.46 
 
 
112 aa  120  6e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.179606  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1363  hypothetical protein  46.79 
 
 
130 aa  98.6  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0901  hypothetical protein  53.42 
 
 
85 aa  90.1  8e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  unclonable  0.0000132219 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0675  hypothetical protein  48.1 
 
 
130 aa  82  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.739735  normal  0.351726 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1941  hypothetical protein  51.67 
 
 
85 aa  67.8  0.00000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4521  hypothetical protein  43.37 
 
 
102 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000119518  normal  0.999425 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6242  hypothetical protein  39.19 
 
 
120 aa  48.9  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.166665  normal  0.0804167 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0868  hypothetical protein  30.09 
 
 
119 aa  45.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.213532 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0522  hypothetical protein  35.71 
 
 
121 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0123938  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3727  hypothetical protein  37.33 
 
 
117 aa  43.1  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1354  hypothetical protein  42.86 
 
 
133 aa  42.4  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.002337  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2989  hypothetical protein  30.77 
 
 
111 aa  41.6  0.004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.701309  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4593  hypothetical protein  34.78 
 
 
109 aa  40.8  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.781109  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>