17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6242 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_6242  hypothetical protein  100 
 
 		 120 aa  238  2e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.166665  normal  0.0804167 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3727  hypothetical protein  39.34 
 
 		 117 aa  62.8  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5309  hypothetical protein  35.78 
 
 		 113 aa  58.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3905  hypothetical protein  44.26 
 
 		 103 aa  53.9  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1594  hypothetical protein  35.29 
 
 		 118 aa  50.4  0.000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3762  hypothetical protein  39.19 
 
 		 113 aa  48.9  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000079403  normal  0.0464919 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0675  hypothetical protein  33.98 
 
 		 130 aa  47.8  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.739735  normal  0.351726 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0901  hypothetical protein  43.86 
 
 		 85 aa  45.4  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000132219 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0522  hypothetical protein  37.5 
 
 		 121 aa  44.7  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0123938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0440  hypothetical protein  40.7 
 
 		 122 aa  43.9  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.728055  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4314  hypothetical protein  34.15 
 
 		 110 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2356  hypothetical protein  38.36 
 
 		 112 aa  43.1  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.179606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2886  hypothetical protein  31.19 
 
 		 118 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4376  hypothetical protein  32.93 
 
 		 110 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000005005  unclonable  0.00000000143863 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0537  hypothetical protein  36.11 
 
 		 115 aa  41.2  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2989  hypothetical protein  33.01 
 
 		 111 aa  40.4  0.009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.701309  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0868  hypothetical protein  35.87 
 
 		 119 aa  40.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.213532 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>