19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_2494 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_2494  hypothetical protein  100 
 
 
122 aa  247  4e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.255706 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2486  hypothetical protein  50 
 
 
121 aa  131  3e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0794808  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4898  hypothetical protein  51.38 
 
 
124 aa  124  6e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.135304  normal  0.116752 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4280  hypothetical protein  44.64 
 
 
115 aa  94.4  4e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1237  hypothetical protein  48.28 
 
 
121 aa  85.9  2e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.106406  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1815  hypothetical protein  36.13 
 
 
125 aa  77.8  0.00000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.245824  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1772  hypothetical protein  32.5 
 
 
122 aa  77  0.00000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.46345  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3291  hypothetical protein  33.33 
 
 
122 aa  68.2  0.00000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1637  hypothetical protein  35.83 
 
 
122 aa  64.7  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0635046  hitchhiker  0.001286 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4084  hypothetical protein  34.43 
 
 
122 aa  63.9  0.0000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0428  hypothetical protein  30.58 
 
 
125 aa  61.2  0.000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0440  hypothetical protein  33.61 
 
 
122 aa  60.1  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.728055  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2504  hypothetical protein  28.33 
 
 
124 aa  58.9  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2206  hypothetical protein  35 
 
 
120 aa  57.4  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000336434 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1914  hypothetical protein  33.71 
 
 
110 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0652972  normal  0.631226 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5909  hypothetical protein  32.97 
 
 
128 aa  48.1  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1889  hypothetical protein  36.84 
 
 
110 aa  47.4  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1771  hypothetical protein  31.15 
 
 
119 aa  47  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.300159  normal  0.312594 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0081  hypothetical protein  34.48 
 
 
111 aa  42  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0127651 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>