28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_1889 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011726  PCC8801_1889  hypothetical protein  100 
 
 
110 aa  225  1e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1914  hypothetical protein  99.09 
 
 
110 aa  223  7e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0652972  normal  0.631226 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1800  hypothetical protein  55.05 
 
 
110 aa  137  3e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0081  hypothetical protein  50.46 
 
 
111 aa  128  3e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0127651 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0499  hypothetical protein  44.95 
 
 
110 aa  106  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.200702  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2091  hypothetical protein  38.18 
 
 
110 aa  89.4  2e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0895  hypothetical protein  46.07 
 
 
109 aa  86.7  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4190  hypothetical protein  39.09 
 
 
110 aa  84.7  3e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.215857 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3433  hypothetical protein  36.7 
 
 
122 aa  81.3  0.000000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4962  hypothetical protein  32.73 
 
 
111 aa  58.5  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1709  hypothetical protein  33 
 
 
114 aa  57.8  0.00000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2877  hypothetical protein  35.05 
 
 
113 aa  57.4  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00521962  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3039  hypothetical protein  35.05 
 
 
113 aa  56.2  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.54673  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2196  hypothetical protein  29.9 
 
 
114 aa  54.7  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0056  hypothetical protein  31.63 
 
 
114 aa  53.9  0.0000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4618  hypothetical protein  33.33 
 
 
114 aa  51.2  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1985  hypothetical protein  32.65 
 
 
111 aa  49.7  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0440  hypothetical protein  34.18 
 
 
122 aa  50.1  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.728055  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4084  hypothetical protein  34.18 
 
 
122 aa  50.1  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2777  hypothetical protein  28.41 
 
 
124 aa  48.5  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2494  hypothetical protein  36.84 
 
 
122 aa  47.4  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.255706 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4512  hypothetical protein  33.9 
 
 
117 aa  46.2  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.90814 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5909  hypothetical protein  34.62 
 
 
128 aa  46.6  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3291  hypothetical protein  33.71 
 
 
122 aa  46.2  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4898  hypothetical protein  35.29 
 
 
124 aa  45.8  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.135304  normal  0.116752 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4629  hypothetical protein  37.29 
 
 
94 aa  44.7  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0600  hypothetical protein  37.25 
 
 
118 aa  41.6  0.004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0476447  normal  0.181324 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2206  hypothetical protein  35.44 
 
 
120 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000336434 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>