16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1709 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011060  Ppha_1709  hypothetical protein  100 
 
 
114 aa  232  1.0000000000000001e-60  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2196  hypothetical protein  70.54 
 
 
114 aa  168  2e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0056  hypothetical protein  64.91 
 
 
114 aa  157  6e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2877  hypothetical protein  51.35 
 
 
113 aa  120  4e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00521962  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3039  hypothetical protein  51.85 
 
 
113 aa  118  3e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.54673  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1985  hypothetical protein  48.65 
 
 
111 aa  107  7.000000000000001e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1889  hypothetical protein  33 
 
 
110 aa  57.8  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1800  hypothetical protein  33.33 
 
 
110 aa  56.2  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1914  hypothetical protein  32 
 
 
110 aa  55.1  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0652972  normal  0.631226 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4190  hypothetical protein  32.46 
 
 
110 aa  54.7  0.0000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.215857 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2091  hypothetical protein  28.57 
 
 
110 aa  52.4  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0499  hypothetical protein  30 
 
 
110 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.200702  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0081  hypothetical protein  27.96 
 
 
111 aa  46.2  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0127651 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3433  hypothetical protein  25.74 
 
 
122 aa  45.4  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0895  hypothetical protein  30 
 
 
109 aa  43.9  0.0007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4512  hypothetical protein  28.43 
 
 
117 aa  40.4  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.90814 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>