27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0081 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_0081  hypothetical protein  100 
 
 		 111 aa  230  6e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0127651 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1800  hypothetical protein  55.45 
 
 		 110 aa  137  7e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1889  hypothetical protein  50.46 
 
 		 110 aa  128  3e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1914  hypothetical protein  49.54 
 
 		 110 aa  125  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0652972  normal  0.631226 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0499  hypothetical protein  44.04 
 
 		 110 aa  105  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.200702  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0895  hypothetical protein  44.55 
 
 		 109 aa  97.4  6e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4190  hypothetical protein  44.04 
 
 		 110 aa  94  7e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.215857 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3433  hypothetical protein  40 
 
 		 122 aa  91.3  4e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2091  hypothetical protein  42.2 
 
 		 110 aa  90.9  5e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4962  hypothetical protein  28.83 
 
 		 111 aa  57.4  0.00000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3039  hypothetical protein  38.98 
 
 		 113 aa  51.6  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.54673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2777  hypothetical protein  31.52 
 
 		 124 aa  50.1  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2196  hypothetical protein  30.43 
 
 		 114 aa  50.1  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4084  hypothetical protein  37.97 
 
 		 122 aa  47.8  0.00005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1237  hypothetical protein  39.34 
 
 		 121 aa  47.8  0.00005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.106406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0440  hypothetical protein  36.71 
 
 		 122 aa  47  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.728055  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1709  hypothetical protein  27.96 
 
 		 114 aa  46.2  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4898  hypothetical protein  35.53 
 
 		 124 aa  45.8  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.135304  normal  0.116752 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2877  hypothetical protein  28.74 
 
 		 113 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00521962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1815  hypothetical protein  38.33 
 
 		 125 aa  45.1  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.245824  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4618  hypothetical protein  46.81 
 
 		 114 aa  44.7  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2262  hypothetical protein  36.23 
 
 		 116 aa  43.9  0.0007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00019364 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2494  hypothetical protein  34.48 
 
 		 122 aa  42  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.255706 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5909  hypothetical protein  36.84 
 
 		 128 aa  41.2  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0056  hypothetical protein  25.81 
 
 		 114 aa  41.2  0.005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1985  hypothetical protein  27.96 
 
 		 111 aa  41.2  0.006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2486  hypothetical protein  36.21 
 
 		 121 aa  40  0.01  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0794808  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>