18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_4962 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_4962  hypothetical protein  100 
 
 
111 aa  222  1e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2091  hypothetical protein  41.82 
 
 
110 aa  84.3  5e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0895  hypothetical protein  39.64 
 
 
109 aa  82.8  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3433  hypothetical protein  31.53 
 
 
122 aa  68.2  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1800  hypothetical protein  30.56 
 
 
110 aa  64.7  0.0000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4190  hypothetical protein  31.82 
 
 
110 aa  62  0.000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.215857 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0499  hypothetical protein  38.38 
 
 
110 aa  59.7  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.200702  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1889  hypothetical protein  32.73 
 
 
110 aa  58.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1914  hypothetical protein  32.73 
 
 
110 aa  58.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0652972  normal  0.631226 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0081  hypothetical protein  28.83 
 
 
111 aa  57.4  0.00000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0127651 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0600  hypothetical protein  22.92 
 
 
118 aa  49.3  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0476447  normal  0.181324 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2642  hypothetical protein  25.77 
 
 
117 aa  47.8  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4618  hypothetical protein  31.82 
 
 
114 aa  47.4  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4629  hypothetical protein  40.38 
 
 
94 aa  45.8  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5087  hypothetical protein  26.8 
 
 
118 aa  44.3  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000115983  normal  0.14262 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3039  hypothetical protein  32.08 
 
 
113 aa  44.3  0.0007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.54673  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4512  hypothetical protein  22.77 
 
 
117 aa  43.9  0.0008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.90814 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0056  hypothetical protein  31.58 
 
 
114 aa  40.8  0.007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>