57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_7883 on replicon NC_011887
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010373  M446_7034  hypothetical protein  86.94 
 
 		 753 bp  660    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0794917  normal  0.0905245 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6108  hypothetical protein  87.7 
 
 		 753 bp  704    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5033  hypothetical protein  86.98 
 
 		 753 bp  664    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8531  hypothetical protein  88.78 
 
 		 753 bp  759    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7883    100 
 
 		 699 bp  1386    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.712837  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6736  putative insertion sequence transposase-like protein  86.66 
 
 		 753 bp  644    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0621826 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8273    86.23 
 
 		 753 bp  620  1e-175  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.11171  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6131  Transposase and inactivated derivatives-like protein  86.98 
 
 		 1041 bp  620  1e-175  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8409  hypothetical protein  86 
 
 		 753 bp  605  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8630  Transposase and inactivated derivatives-like protein  85.94 
 
 		 960 bp  597  1e-168  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1878    85.65 
 
 		 972 bp  581  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1866  putative insertion sequence transposase-like protein  85.37 
 
 		 753 bp  573  1e-161  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.308333  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1886  putative transposase  85.08 
 
 		 753 bp  557  1e-156  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1881  putative insertion sequence transposase-like protein  84.7 
 
 		 741 bp  547  1e-153  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4991    84.69 
 
 		 752 bp  529  1e-148  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3376    84.65 
 
 		 752 bp  525  1e-147  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3932    84.02 
 
 		 754 bp  478  1e-132  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1892    84.33 
 
 		 753 bp  464  9.999999999999999e-129  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0824    89.17 
 
 		 522 bp  446  1e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.799947  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3886  putative insertion sequence transposase-like protein  85.39 
 
 		 684 bp  440  1e-121  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.829291  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8427    85.91 
 
 		 503 bp  428  1e-118  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.51552  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8695    83.78 
 
 		 754 bp  426  1e-117  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.221639  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6405    86.68 
 
 		 450 bp  410  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8317  hypothetical protein  82.25 
 
 		 753 bp  398  1e-109  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.324415  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2525    81.92 
 
 		 753 bp  383  1e-104  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5422  putative insertion sequence transposase-like protein  81.38 
 
 		 753 bp  337  3e-90  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5438  putative insertion sequence transposase-like protein  81.38 
 
 		 753 bp  337  3e-90  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8706    83.86 
 
 		 456 bp  309  6e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.767164  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7846  putative insertion sequence transposase-like protein  87.41 
 
 		 705 bp  289  5e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2686    84.68 
 
 		 391 bp  278  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6408    87.38 
 
 		 309 bp  202  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3233    83.05 
 
 		 716 bp  188  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2990    85.4 
 
 		 336 bp  186  6e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6183    82.8 
 
 		 337 bp  182  9e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3889    88.46 
 
 		 189 bp  167  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.333986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2636    85.59 
 
 		 635 bp  99.6  1e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8268  hypothetical protein  83.22 
 
 		 297 bp  97.6  4e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0489738  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0071  transposase  83.9 
 
 		 675 bp  83.8  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.507355 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0970    82.61 
 
 		 466 bp  83.8  0.00000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8326    85.57 
 
 		 219 bp  81.8  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3818    82.48 
 
 		 707 bp  73.8  0.00000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3910    81.05 
 
 		 748 bp  73.8  0.00000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.570348  n/a   
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8804    87.5 
 
 		 243 bp  71.9  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010373  M446_7035    93.75 
 
 		 135 bp  71.9  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0950215  normal  0.0781378 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6119    87.5 
 
 		 105 bp  71.9  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4993    89.71 
 
 		 104 bp  71.9  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1084    95.12 
 
 		 183 bp  65.9  0.00000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.219897  normal  0.823309 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3803  putative insertion sequence transposase-like protein  82.3 
 
 		 780 bp  65.9  0.00000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.6204 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3813    82.69 
 
 		 703 bp  63.9  0.00000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.562408  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8070  transposase  94.74 
 
 		 1041 bp  60  0.0000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.837659  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0553  hypothetical protein  90 
 
 		 228 bp  60  0.0000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.152843  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1884    87.1 
 
 		 168 bp  60  0.0000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6479  hypothetical protein  86.67 
 
 		 225 bp  56  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3882  transposase, putative  89.36 
 
 		 711 bp  54  0.00006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.227634 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2581  putative transposase  89.13 
 
 		 102 bp  52  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0987    79.45 
 
 		 201 bp  52  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.721005  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8340  hypothetical protein  87.76 
 
 		 201 bp  50.1  0.0009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>