49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_2686 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_2686    100 
 
 
391 bp  775    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8630  Transposase and inactivated derivatives-like protein  84.62 
 
 
960 bp  280  3e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7883    84.68 
 
 
699 bp  278  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.712837  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8531  hypothetical protein  84.14 
 
 
753 bp  262  7e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6108  hypothetical protein  83.81 
 
 
753 bp  260  3e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6131  Transposase and inactivated derivatives-like protein  83.81 
 
 
1041 bp  260  3e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8695    83.55 
 
 
754 bp  250  3e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.221639  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8409  hypothetical protein  83.2 
 
 
753 bp  244  2e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8273    82.95 
 
 
753 bp  236  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.11171  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6736  putative insertion sequence transposase-like protein  82.77 
 
 
753 bp  228  9e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0621826 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5033  hypothetical protein  82.63 
 
 
753 bp  222  6e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8317  hypothetical protein  81.87 
 
 
753 bp  202  5e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.324415  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2990    86.89 
 
 
336 bp  186  3e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010373  M446_7034  hypothetical protein  81.2 
 
 
753 bp  180  2e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0794917  normal  0.0905245 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3886  putative insertion sequence transposase-like protein  80.94 
 
 
684 bp  172  5e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.829291  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6408    85.65 
 
 
309 bp  168  6.9999999999999995e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3376    81.39 
 
 
752 bp  167  3e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1866  putative insertion sequence transposase-like protein  81.65 
 
 
753 bp  165  1e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.308333  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1878    80.68 
 
 
972 bp  165  1e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1881  putative insertion sequence transposase-like protein  80.68 
 
 
741 bp  165  1e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1886  putative transposase  80.64 
 
 
753 bp  161  2e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0824    88.49 
 
 
522 bp  149  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.799947  n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5438  putative insertion sequence transposase-like protein  80.81 
 
 
753 bp  147  3e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5422  putative insertion sequence transposase-like protein  80.81 
 
 
753 bp  147  3e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7846  putative insertion sequence transposase-like protein  80.42 
 
 
705 bp  135  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8427    82 
 
 
503 bp  111  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.51552  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2636    83.54 
 
 
635 bp  111  1e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4991    80.69 
 
 
752 bp  97.6  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0987    82.32 
 
 
201 bp  95.6  9e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.721005  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2525    80 
 
 
753 bp  93.7  4e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3932    80.47 
 
 
754 bp  85.7  0.000000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6405    82.52 
 
 
450 bp  85.7  0.000000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1892    81.94 
 
 
753 bp  85.7  0.000000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3233    81.18 
 
 
716 bp  83.8  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8268  hypothetical protein  83.21 
 
 
297 bp  81.8  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0489738  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8706    81.29 
 
 
456 bp  69.9  0.0000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.767164  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3818    81.88 
 
 
707 bp  67.9  0.000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8070  transposase  93.18 
 
 
1041 bp  63.9  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.837659  n/a   
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3910    82.41 
 
 
748 bp  63.9  0.00000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.570348  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3803  putative insertion sequence transposase-like protein  79.53 
 
 
780 bp  61.9  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.6204 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0071  transposase  87.1 
 
 
675 bp  60  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.507355 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3813    82.35 
 
 
703 bp  60  0.0000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.562408  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6183    84.51 
 
 
337 bp  54  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7493    82.76 
 
 
195 bp  54  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8326    90.48 
 
 
219 bp  52  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2581  putative transposase  93.94 
 
 
102 bp  50.1  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0970    83.56 
 
 
466 bp  50.1  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6479  hypothetical protein  85 
 
 
225 bp  48.1  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010373  M446_7035    88.37 
 
 
135 bp  46.1  0.007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0950215  normal  0.0781378 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>