64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_3376 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010373  M446_7034  hypothetical protein  87.18 
 
 
753 bp  708    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0794917  normal  0.0905245 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6108  hypothetical protein  86.06 
 
 
753 bp  652    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1866  putative insertion sequence transposase-like protein  86.99 
 
 
753 bp  694    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.308333  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1878    87.27 
 
 
972 bp  718    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6736  putative insertion sequence transposase-like protein  87.58 
 
 
753 bp  731    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0621826 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1886  putative transposase  86.62 
 
 
753 bp  660    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3376    100 
 
 
752 bp  1491    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5033  hypothetical protein  85.97 
 
 
753 bp  630  1e-178  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8630  Transposase and inactivated derivatives-like protein  85.83 
 
 
960 bp  620  1e-175  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6131  Transposase and inactivated derivatives-like protein  86.14 
 
 
1041 bp  617  9.999999999999999e-175  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1881  putative insertion sequence transposase-like protein  85.35 
 
 
741 bp  611  9.999999999999999e-173  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1892    85.56 
 
 
753 bp  591  1e-166  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4991    85.16 
 
 
752 bp  581  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8531  hypothetical protein  84.78 
 
 
753 bp  573  1e-161  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8409  hypothetical protein  84.8 
 
 
753 bp  565  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2525    84.59 
 
 
753 bp  555  1e-156  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3886  putative insertion sequence transposase-like protein  86.69 
 
 
684 bp  535  1e-150  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.829291  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8273    84.06 
 
 
753 bp  533  1e-149  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.11171  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7883    84.65 
 
 
699 bp  525  1e-147  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.712837  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3932    83.98 
 
 
754 bp  498  9.999999999999999e-139  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8317  hypothetical protein  82.34 
 
 
753 bp  430  1e-118  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.324415  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8695    82.72 
 
 
754 bp  424  1e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.221639  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8427    85.35 
 
 
503 bp  391  1e-106  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.51552  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6405    86.02 
 
 
450 bp  363  5e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0824    85.89 
 
 
522 bp  343  4e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.799947  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7846  putative insertion sequence transposase-like protein  89 
 
 
705 bp  333  4e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6183    86.02 
 
 
337 bp  270  5e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6408    88.21 
 
 
309 bp  268  2e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3233    85.76 
 
 
716 bp  252  1e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8706    82.22 
 
 
456 bp  222  1e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.767164  n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5438  putative insertion sequence transposase-like protein  82.76 
 
 
753 bp  206  7e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5422  putative insertion sequence transposase-like protein  82.76 
 
 
753 bp  206  7e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2990    84.55 
 
 
336 bp  168  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2686    81.39 
 
 
391 bp  167  6e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8268  hypothetical protein  85.64 
 
 
297 bp  163  9e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0489738  n/a   
 
 
-
 
NC_010373  M446_7035    94.23 
 
 
135 bp  151  3e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0950215  normal  0.0781378 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3889    86.42 
 
 
189 bp  147  5e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.333986  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0970    84.41 
 
 
466 bp  139  9.999999999999999e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8340  hypothetical protein  89.32 
 
 
201 bp  117  5e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0553  hypothetical protein  86.78 
 
 
228 bp  105  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.152843  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8326    81.28 
 
 
219 bp  101  3e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6479  hypothetical protein  89.89 
 
 
225 bp  97.6  4e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3350  putative transposase  86.54 
 
 
162 bp  87.7  0.000000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2581  putative transposase  85 
 
 
102 bp  79.8  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8070  transposase  81.29 
 
 
1041 bp  77.8  0.000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.837659  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8600  hypothetical protein  92.59 
 
 
120 bp  75.8  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.27479  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7012    78.17 
 
 
748 bp  71.9  0.0000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8390  hypothetical protein  95.24 
 
 
120 bp  67.9  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7154  transposase  81.34 
 
 
675 bp  67.9  0.000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8176  hypothetical protein  84.04 
 
 
228 bp  67.9  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.532624  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3803  putative insertion sequence transposase-like protein  81.6 
 
 
780 bp  65.9  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.6204 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4257  hypothetical protein  85 
 
 
207 bp  63.9  0.00000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3910    100 
 
 
748 bp  61.9  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.570348  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0071  transposase  88.14 
 
 
675 bp  61.9  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.507355 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2636    97.06 
 
 
635 bp  60  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7493    88.89 
 
 
195 bp  60  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2215    92.5 
 
 
174 bp  56  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.673879 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0987    82.95 
 
 
201 bp  56  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.721005  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4993    87.1 
 
 
104 bp  52  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3905  hypothetical protein  87.04 
 
 
150 bp  52  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3813    96.55 
 
 
703 bp  50.1  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.562408  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6119    88.64 
 
 
105 bp  48.1  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3176  hypothetical protein  96.43 
 
 
258 bp  48.1  0.004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.000790904  normal  0.0520266 
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8804    88.64 
 
 
243 bp  48.1  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>